国际免疫学杂志的投稿流程遵循严谨的同行评审制度，包括编辑初审、专家外审和编委会终审三个阶段。稿件如不被接受，作者会收到详细的退稿意见，对于处理结果有异议的，作者有权申请复议并提交书面申诉。
对于"快速通道"论文，要求具备创新性、重要性和科学性，预期对临床和科研工作产生重大影响。在投稿前，作者需先与编辑部沟通研究详情，确保稿件符合刊约并附单位介绍信。作者需提交书面材料，阐述论文走"快速通道"的理由，同时需提供省级及以上图书馆或医学信息研究所的查新报告，还需两位高级职称同行专家（至少一位非本单位专家）的推荐意见。作者可推荐3至5名审稿专家供编辑部参考。
一旦稿件被接收，作者需签署论文专有使用授权书，允许中华医学会以电子期刊、光盘版或网络等形式出版。未经许可，论文不得在其他地方转载。值得注意的是，如果在接到本刊收稿回执3个月内未收到处理通知，稿件可能仍在审阅中。若作者打算投向其他期刊，务必先与本刊沟通，避免一稿两投。一旦发现一稿两投，稿件将被立即退回，并采取相应的处理措施，包括论文撤销、发表声明以及对作者单位和科技期刊通报等，且两年内将拒绝该作者以该文为第一作者的投稿。
作者需确保来稿的真实性和科学性，本刊有权对稿件进行文字修改和删减。涉及原意的修改，编辑会与作者沟通。若修改稿超过两个月未返回，将视为自动撤稿。
《国际免疫学杂志》原名称为《国外医学》免疫学分册，是由中华人民共和国卫生部主管，中华医学会和哈尔滨医科大学联合主办，公开发行的国家级学术期刊。主要介绍国内外医学免疫学研究进展，旨在推动我国免疫学的发展。