医疗卡和医保卡是有本质的区别，在南京的医院看病，如果没有医保卡，也可以现场办理医疗卡，但医疗卡属于自费性质，不能享受医疗统筹保障，对于患者来说可能会负担较重。医保卡则是可以享受医疗统筹的，过了报销门槛以后看病费用相对来说比医疗卡要节省很多。
具体有四点不同：
第一、概念不同。社会保障卡简称社保卡，由各地人力资源和社会保障部门面向社会发行，用于人力资源和社会保障各项业务领域的集成电路卡。医疗保险卡或医保卡，是医疗保险个人帐户专用卡，以个人身份证为识别码，储存记载着个人身份证号码、姓名、性别以及帐户金的拨付、消费情况等详细资料信息。
第二、功能不同。社保卡不仅具有医保卡功能，还是办理各项社保业务的重要凭证，例如领取失业金等等。但医保卡仅限于医保功能，只能用来享受医保待遇。
第三、发卡地方不同。医疗保险卡由当地指定代理银行承办，而社会保障卡由各地人力资源和社会保障部门面向社会发行。
第四、安全性能不同。社保卡采取了全国统一的三层密钥管理体系，它的安全性、可靠性已通过国家验收，真正能够使社会保障卡成为参保人员的“安全卡”、“放心卡”，也为未来实现跨省的全国通用打好了基础;而医保卡则没有这种管理体系，安全系数较低。
法律依据：
《中华人民共和国社会保险法》
第二条 国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。
第三条 社会保险制度坚持广覆盖、保基本、多层次、可持续的方针，社会保险水平应当与经济社会发展水平相适应。
第四条 中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个人权益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。
个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。
第五条 县级以上人民政府将社会保险事业纳入国民经济和社会发展规划。
国家多渠道筹集社会保险资金。县级以上人民政府对社会保险事业给予必要的经费支持。
国家通过税收优惠政策支持社会保险事业。
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