一、性质不同
1、结构胶：强度高、在预期寿命内性能稳定的密封材料。
2、密封胶：随密封面形状而变形，不易流淌，有一定粘结性的密封材料。
二、特点不同
1、结构胶：能承受较大荷载，且耐老化、耐疲劳、耐腐蚀，在预期寿命内性能稳定。
2、密封胶：防止液体泄漏、阻隔氧气、湿气、异味进入，防伪造、伪劣产品。
三、应用不同
1、结构胶：主要用于构件的加固、锚固、粘接、修补等；如粘钢，粘碳纤维，植筋，裂缝补强、密封，孔洞修补、道钉粘贴、表面防护、混凝土粘接等。
2、密封胶：广泛用于建筑、交通运输、电子仪器仪表及零部件的密封。
参考资料来源：
百度百科-结构胶
百度百科-密封胶