是奈克瑟斯奥特曼剧场版：THE ULTRAMAN 前往调查地落在太平洋的不明飞行物的海上自卫队二尉－－有恸贯文,突然遭遇到蓝色光芒,而在这光芒影响下其细胞产生突然异变而变成凶恶怪兽"THE ONE"，并四处袭击。防卫队的攻击依然无效，之后他在防卫厅的特殊机关BCST(对生物恐怖活动研究机关)的监视下脱逃而失去踪迹…… 另一方面,航空自卫队F15J战机驾驶员-真木舜一,为了患有先天性疾病的儿子继梦在一起,因而而决定辞职。就在最后一次飞行时,真木在空中跟一个神秘的红色光芒在空中发生冲撞。此事跟"THE ONE"事件相隔了3个月，真木奇迹生还,然后转职成民航机飞行员,展开了新生活。 对这样的真木还是有机关非常关注,尤其是BCST中的化学担当官－－水原沙罗。BCST将真木强制带走,在废工厂中搭建的BCST研究室进行身监视禁锢。此时行踪不明的怪"THE ONE"像被某种东西吸引而现身了，真木感觉到他的气息，开始变得焦虑、急躁，非常痛苦。可惜，BCST还是没有帮助真木。之后，THE ONE出现了，防卫队虽然用特殊子弹射死了他，但THE ONE拥有吸收各种生物进化的能力，死了之后依然能吸收了大量的生物进化，从而使到THE ONE复活并巨大化。残暴的THE ONE不断攻击，令到真木失控，最终撞坏了地牢的铁门，出现在THE ONE面前。遭受"THE ONE"攻击而濒死的真木,身体发生了变化,在红光的力量之下变身了！ 变身成身高10米拥有银色的钢铁身体型态,偶而还有自己意志的真木,跟THE ONE展开作战,但是由于超人和真木不完全融合,以致能量快速消耗,在遭到决定性的一击后变回了真木。然后沙罗将这个在"THE ONE"之后出现的生命体定名为"THE NEXT"，真木在从东京被护送回BCST研究室的途中被某种预知能力得知儿子继梦入院的消息,在赶到医院后跟妻子蓉子再次的碰面了。 此时,人类最大的危机出现了,"THE ONE"在东京的下水道袭击人类，真木和沙罗赶到目的地，却见到光着身子的有恸向着他们走来，但沙罗下决心向有恸开枪。有恸的身体再次被THE ONE侵蚀，向沙罗袭击。这个时候的有恸已经被"THE ONE"取代,已经成为不能变回为人的姿态了。 为了保护无辜的人类，真木再次变身！在这次战斗里面，奈克斯特进化为身高40米，身体的肌肉部分渗透红色的血的巨人！！ 现在，以新宿副市中心，"THE NEXT"与"THE ONE"的决战之火开始燃烧了！ 正是由于奥特曼和真木没有完全融合，真木才没有身亡。但是，奥特曼为了不再连累真木，于是两者分离了，真木继续幸福的生活，奥特曼却继续寻找下一个适能者……
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