清华最开始的分配方式是按照各省分担的庚子赔款的比例分配，这是清华招生的雏形，或者说骨架。清华学校在那时尚不大引人注目。学校的创立乃是由于美国退还庚子赔款半数指定用于教育用途，意思是好的，但是带着深刻的国耻的意味。所以这学校的学制特殊，事实上是留美预备学校，不由教育部管理，校长有外交部派。随着社会时间的变迁，我们国家逐渐发展强大，现在的清华大学已是我们国家的最高学府，基本上根据各省的按照人口比例和生源质量也有所浮动了。
清华大学由中华人民共和国教育部直属，位列“211工程”、“985工程”，入选”珠峰计划“、”2011计划“、”111计划“、”卓越工程师教育培养计划“、”卓越法律人才教育培养计划“、”卓越医生教育培养计划“，是C9联盟、东亚研究型大学协会、环太平洋大学联盟、清华—剑桥—麻省理工学院低碳能源大学联盟成员，中管副部级建制。截至2014年3月31日，清华大学正在运行的科研机构共322个，其中政府部门批准建立的科研机构共123个，包含国家实验室（筹）1个，重大科技基础设施1个，国家大型科学仪器中心2个，国家重点实验室13个，国家工程实验室7个，国家工程研究中心4个，教育部重点实验室17个，北京市重点实验室13个。
参考资料
百度百科.百度百科[引用时间2018-4-23]
庚子赔款比例决定了各省招生比例。
庚子赔款中，其中各省分担数额如下：直隶80万两，江苏250万两，湖北120万两，山东90万两，河南90万两，安徽100万两，山西90万两，甘肃30万两，陕西60万两，福建80万两，新疆40万两；
江西140万两，浙江140万两，湖南70万两，四川220万两，广东200万两，云南30万两，贵州20万两，合计1880万两。
看的出来赔的最多的是江苏省250万元。四川省220万了。广东省200万两，浙江省140万。湖北省120万了。少的省份是贵州省，云南省。贵州省清华北大录取比例最低，原因就在这里。
这就是清华北大录取人数最多的省份是江苏，浙江，湖北，四川的原因。当时的江苏包括上海，江苏的清华北大录取比例全国第一(北京例外)。据说这是美国人规定清华大学各省招生指标按照庚子赔款各省分摊比例考量，哪个省分摊得多，哪个省就招生多，清华大学无权作出决定。
人口影响因素
各省的人口多少，考生多寡也是清华大学在各省录取人数分配影响的一个重要因素。因为河南省，山东省，广东省人口都是上亿的人口大省，所以，招生人数适当提高。清华大学在河南省的招生人数已经在全国处于前列，但是由于庞大的考生基数，录取比例仍然是全国倒数水平。
贫困专项计划
清华大学高校专项计划，主要面向边远、贫困地区的农村学生。
所以清华大学在各省录取人数是以庚子赔款各省贡献比例为基础，结合各省人口多少，贫困生比例，高考数学物理重视程度等，进行是适当调配。
本回答被网友采纳还有一个，广东和四川的庚子赔款也很多，前三名。但清华北大分给广东和四川的名额却少得可怜！
招生比例是参考了庚子赔款来分配的，庚子赔款是各省分担筹集的，所以清华大学的招生比例就按照各个省份的捐款比例来招生的，不仅是清华，北京的很多大学也参照清华的名额分配。
庚子赔款各省分摊比例是: 北京80万两，江苏250万两，广东200万两，四川220万两，浙江140万两，江西140万两，湖北120万两，安徽100万两，山东90万两，河南90万两，山西90万两，湖南70万两，甘肃30万两，陕西60万两，福建80万两，新疆40万两，云南30万两，贵州20万两。
庚子赔款简介：
1900年（庚子年），义和团运动在中国北方部分地区达到高潮，大清帝国和国际列强开战，八国联军占领了北京紫禁城皇宫。1901年（辛丑年）9月，中国和11个国家达成了屈辱的《解决1900年动乱最后议定书》，即《辛丑条约》。条约规定，中国从海关银等关税中拿出4亿5千万两白银赔偿各国，并以各国货币汇率结算，按4%的年息，分39年还清。这笔钱史称“庚子赔款”，西方人称为“拳乱赔款”（Boxer Indemnity）。