一、根部的不同：
前者为菌类，不是植物，所以没有根的存在，是寄生在松类树木根部的真菌物质。
后者是藤蔓植物，有根叶等植物的特征，叶子厚大且光滑。根部形状为一节一节的，可以看到明显的节状，同时还有一些小须根长在上面。
二、形状的不同：
前者形状是圆形的或者长圆形的，呈现圆球状，外表上像甘薯一样，外表是黄棕色，切开之后可以看到里面的物质是白色的，类似于豆腐的颜色。
土茯苓虽然长相上与前者略微相似，外表颜色呈黄褐色，切开之后里面物质显示为淡黄色。
三、功效的区别
茯苓归心脾肾经，性味甘淡平，有利水渗湿的功能，还可健脾安神，咀嚼的时候会粘牙
土茯苓归肝胃经，甘涩且偏于味苦，主治梅毒及汞中毒所致的肢体拘挛，筋骨疼痛；湿热淋浊，带下。土茯苓除了清热解毒，还有除湿作用，《内经》所谓湿气害人皮肉筋骨是也。
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扩展资料：
土茯苓，中药名。为百合科植物光叶菝葜的干燥根茎，其为多年生常绿攀缘状灌木，多生于山坡或林下。入药部分只选择其干燥后的根茎。
常于夏、秋二季采挖，除去须根，洗净后干燥入药；或趁鲜切成薄片后干燥、入药。味甘、淡，性平。有解毒，除湿，通利关节之功效，主要用于梅毒及汞中毒所致的肢体拘挛，筋骨疼痛；湿热淋浊，带下，痈肿，瘰疬，疥癣。
茯苓，中药名。为多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核。多于7～9月采挖，挖出后除去泥沙，堆置“发汗”后，摊开晾至表面干燥，再“发汗”，反复数次至现皱纹、内部水分大部散失后，阴干，称为“茯苓个”；或将鲜茯苓按不同部位切制，阴干，分别称为“茯苓块”和“茯苓片”。
参考资料：
/baike.baidu.com/item/土茯苓/1537151?fr=aladdin"target="_blank">百度百科——土茯苓
/baike.baidu.com/item/茯苓/302589?fr=aladdin"target="_blank">百度百科——茯苓