剧场版都不错呢，我都很喜欢的~
第一部《引爆摩天大楼》，第二部《第十四个目标》，第三部《世纪末的魔术师》（基德噢~~），第四部《瞳孔中的暗杀者》（新兰恋，表白超级经典~~），第五部《通往天国的倒计时》（有黑衣组织~），第六部《贝克街的亡灵》（和福尔摩斯有关系哦~很赞的！），第七部《迷宫的十字路口》（平和恋，有新一出场~主题曲《time after time》最为出彩！），第八部《银翼的奇术师》（KID,新一，都好帅的说~还有小兰的表白！~），第九部《水平线上的阴谋》（毛利小五郎的那句话简直帅完了！这是大叔难得地认真和展现自己推理水平的一部噢，不过没有前几部好就对了~），第十部《侦探们的镇魂歌》（四大帅哥齐聚！白马探，KID,平次，柯南~剧情紧凑超级好看~），第十一部《绀碧之棺》（讲述的是小兰和园子的友情，有加勒比海盗的风范~片尾曲《跨越七海的风》特别好听~~剧情没前几部好……），第十二部《战栗的乐谱》（整部作品就音乐比较出彩，剧情没太大意思，不过也还不错……）
剧场版比较推荐的就是1，2，3，4，5，6，8，10
特别版都比较赞的！
【OVA全集】
OVA1 柯南VS基德VS阿剑!宝刀争夺大战（柯南的一场梦，有KID出场~）
OVA2 16人的嫌疑犯
OVA3 柯南与平次与消失的少年
OVA4 柯南和基德和水晶之母
OVA5 目标是小五郎 少年侦探团的秘密报告
OVA6 追踪消失的钻石 柯南平次vs基德
OVA7 来自阿笠的挑战书!阿笠vs柯南vs少年侦探团
OVA8 女子高中生侦探 铃木园子事件簿
OVA9 10年后的陌生人（新兰恋，感动死了T T）
TV版个人比较推荐的有这几集
011 钢琴奏鸣曲《月光》杀人事件
027 小五郎同学会杀人事件(上集)
028 小五郎同学会杀人事件(下集)（小兰和柯南一起洗澡哦~）
129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件
132 魔术爱好者杀人事件(事件篇)
133 魔术爱好者杀人事件(疑惑篇)
134 魔术爱好者杀人事件(解决篇)
136 青色古堡探索事件(上集)
137 青色古堡探索事件(下集)（有些恐怖，但是比较喜欢这集的哀。超美！）
162 飞天密室 工藤新一最初的事件
184 诅咒的假面的冷笑
188 危命的复活 洞窟内的侦探团
189 危命的复活 负伤之下的名侦探
190 危命的复活 第三个选择 B
191 危命的复活 黑衣骑士 B
192 危命的复活 新一回来了
193 危命的复活 约定的场所 （这是最让人感动的了，T T新兰恋……超级经典！！！必须要看的，一共6集！！）
222 人鱼失踪记(事件篇)
223 人鱼失踪记(推理篇)
224 人鱼失踪记(解决篇)（平次和和叶，很感动！很经典的！）
230 迷一样的乘客(上集)
231 迷一样的乘客(下集)（赤井秀一初登场）
277 英语教师VS西部名侦探(上集)
278 英语教师VS西部名侦探(下集) （茱蒂和平次的推理对决~）
286 工藤新一纽约事件(事件篇)
287 工藤新一纽约事件(推理篇)
288 工藤新一纽约事件(解决篇) （新兰恋，赤井秀一，还有黑衣组织的一些关系……）
304 震动警视厅 1200万名人质（非常经典！！！松田阵平和佐藤……还有高木……）
342 豪斯登堡的新娘
345 与黑衣组织直面对决 满月之夜的双重谜案（最最经典！有黑衣组织，还有有希子，平次，新一！）
356 怪盗基德的惊异空中步行（帅呆了的！）
383 甲子园的奇迹！绝不能输给看不见的恶魔（经典经典！）
425 黑暗冲击！组织魔爪伸来的瞬间（看名字就知道了，黑衣组织！）
437 上户彩和新一 4年前的约定（新一新一！！~~）
472 工藤新一少年的冒险(前篇)
473 工藤新一少年的冒险(后篇) （小时候的新兰~~）
479 和服部平次在一起的3天
490 服部平次vs工藤新一 滑雪场的推理对决
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 绝叫
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职 （赤井秀一T T黑衣组织！推理完美!绝对地经典中的经典啊！）
521 杀人犯，工藤新一
522 新一的真实身份与兰的眼泪
523 真正想问的事 （感动，还是感动T T新兰恋……）
537 怪盗基德VS最强金库（前篇）
538 怪盗基德VS最强金库（后篇）
参考资料：http://baike.baidu.com/view/2898.htm#8