1明确设定实验因子和反应因子
实验因子是指实验所操纵的因子，反应因子是指由操纵实验因子所引起的变化（即实验结果），它们的确定是进行方案设计的前提。如在“
酸碱度对酶催化作用的影响”的实验中，实验因子是溶液ph值的变化，反应因子是酶催化作用的强弱。
2有效控制无关因子
所谓的无关因子并不是与实验效果无关，而是指除实验因子外也影响实验效果的因子，只是这些因子不是本实验所要探究、关心的实验因子。要考察实验因子所产生的效果，就要对无关因子进行控制，这是实验设计最显著、最重要的特点，是实验设计应遵循的基本准则。最常用的控制无关因子的方法主要有：
3成功操纵实验因子
我们正是通过操纵实验因子来观察或测量反应因子的变化的，因此实验因子的成功操纵是实验的核心。如离子交换吸附实验中的实验因子是溶液中有无离子，因此能否确保对照组中的液体无离子（实验因子的操纵）是实验能否成功的关健。
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科学观察反应因子
实验结果是否准确，也取决于确定的观察或测量指标是否得当、是否合理、是否全面、是否清楚。如在上述“酸碱度对酶催化作用的影响”实验中，加入碘液以观察溶液有否变蓝及变蓝的程度来确定
淀粉酶是否起作用及催化作用的强弱。
5需要注意的基本原则
1、科学性原则：
2、可行性原则：
3、简便性原则：
4、可重复性原则：重复、对照、随机是保证实验结果准确的三大原则。
5、单一变量原则：不论一个实验有几个实验变量，都应确定一个实验变量对应观测一个反应变量，这就是单一变量原则，它是处理实验中的复杂关系的准则之一。
6、对照性原则：实验中的
无关变量很多，必须严格控制，要平衡和消除无关变量对实验结果的影响，
对照实验的设计是消除无关变量影响的有效方法。只有设置对照实验，才能有效地排除其它因素干扰结果的可能性。
设置对照组有4种方法：
(1)空白对照：即不给对照组做任何处理；例如，在“唾液淀粉酶催化淀粉”的实验中，实验组滴加了唾液淀粉酶液，而对照组只加了等量的
蒸馏水，起空白对照。
(2)条件对照：这种对照方法是指不论实验组还是对照组的对象都作不同条件的处理，目的是通过得出两种相对立的结论，以验证实验结论的正确性。
(3)自身对照:指对照组和实验组都在同一研究对象上进行，不再另外设置对照组；例如，“
质壁分离与复原”实验，自身对照简便，但关键要看清楚实验处理前后的现象及变化差异。
(4)相互对照:不单独设置对照组，而是几个实验相互为对照。这种方法常用于等组实验中。“植物向光性”实验中，利用若干组燕麦胚芽鞘的不同条件处理的实验组之间的对照，说明了
生长素与植物生长弯曲的关系。