法律分析：可以辞职，但是不可以随便辞职。合同工是企业、事业单位通过签订合同招收的短期性工人，且合同一般采取书面形式，合同内容规定了时限、任务及共同遵守的各项义务等。所以不可以随便辞职，只有到期才可以辞职。而违约金作为合同担保的措施之一，作为违反合同的责任承担方式，如果一方因个人原因解除合同，是要交违约金的。
不过，辞职是可以和事业单位进行商量的，如果双方协商一致，就可以解除合同。事业单位的合同工可以按照《劳动合同法》的规定向用人单位提出辞职。即试用期内提前三天通知用人单位，试用期后的提前三十天通知用人单位，即可以合法解除劳动关系。
法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》
第三十六条 用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。
第三十七条 劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。