GBA模拟器主要能玩的是第三世代的游戏，第三世代肯定是红
蓝宝石的资料片绿宝石最好玩了，毕竟要素最多最丰富。
第三世代，是指以
红宝石蓝宝石开始，至钻石珍珠发售前的所有宝可梦游戏系列，包含了386种宝可梦，主要运行在GBA平台上。
这个世代主要包括了红宝石蓝宝石、绿宝石以及火红叶绿。冒险地点分别在丰缘地区和关都地区（包括七之岛），红宝石蓝宝石和绿宝石最初的伙伴是木守宫火稚鸡和水跃鱼，火红叶绿的最初的伙伴是妙蛙种子、
小火龙和杰尼龟。
第三世代与之前世代的地图和故事上完全分离，主角无法前往前世代的地区。
本世代首次出现地区图鉴的概念，地区图鉴并不包含所有的宝可梦。
第二世代和第三世代之间是第一次出现两个世代之间没有任何跨世代传送宝可梦的方式。
在红宝石蓝宝石发售时，一些前两个世代的宝可梦虽然存在于游戏数据中，但无法透过正常途径获得，直至圆形竞技场及火红叶绿的发售才以让这些宝可梦正式出现在第三世代。
这种情况造成了凤王和
洛奇亚这两只宝可梦从红宝石蓝宝石直到心金魂银之前都只能通过官方活动或者与旁支系列游戏联动才可以得到，这段时间内也被官方称为幻之宝可梦。
第三世代及其重制作品的传说的宝可梦的体系可能是建立在希伯来神话和诺斯底主义的基础之上。
第三世代对应的动画出现下一世代宝可梦的情况是最多的，其中包括小卡比兽和魔尼尼。
第三世代的游戏卡带采用了Flash存储芯片来进行游戏存档，因此在非人为破坏情况下，卡带不会丢失进度，而红宝石蓝宝石绿宝石存在时钟电路，依然需要电池驱动时钟，但存档不再需要电池。
第三世代也是首次提出重制作品的概念的一个世代。