水土流失对土地资源以及生态环境造成极其严重的危害。估计全国每年流失表土50亿吨以上，因此损失的营养物质约折合化肥4000万吨。水土流失不仅直接破坏土地资源，而且导致严重的河湖水库淤积，使它们的功能持续下降，洪水灾害加剧。例如，黄河中下游河床每年淤高4～12厘米，导致河床高出两岸地面一般3～5米，部分河段高出10米以上，最高达16米，成为举世瞩目的“地上悬河”;长江中下游干流也逐年淤高，行洪能力不断下降;洞庭湖、鄱阳湖等大量湖泊迅速淤浅萎缩，蓄水调洪能力严重下降，还有许多湖泊干涸消逝。此外，水土流失还严重破坏森林、植被，导致流域环境恶化，成为许多地区严重贫困的根本原因。水土流失造成的经济损失是相当惊人的，估计全国损失总计达96亿元/年，约相当于1992年全国国民生产总值的0.4%。又如青海省每年从土壤中流失的肥分折合标准化肥相当于全省每年施用化肥的2倍以上，直接经济损失约2.9亿元;山东、云南、广东的损失也分别达10亿元、6.7亿元、3.15亿元。
中国现有沙漠化土地共计154万平方千米，约占国土面积的16%，其中沙漠化土地34平方千米，风沙化土地4万平方千米。中国的沙漠和沙漠化土地主要分布在北纬37°～42°的区域，以新疆、甘肃、青海、宁夏、陕西、山西、河北等省(自治区)最严重。沙漠化不仅对土地资源造成严重破坏，使我国耕地质量不断下降，数量不断减少，人多地少的矛盾更加突出，而且破坏生态环境，加剧旱灾、风灾、沙尘暴等灾害，造成更加深远的危害。
我国盐碱化土地除大部分分布在人口稀少的内陆荒漠地区外，还有近8万平方千米的盐碱化土地分布在农田耕作区，因此使耕地质量下降，农作物减产，甚至无法耕种，一些地区农业生产因此受到严重影响。例如，山东省因盐碱化每年造成的经济损失20亿元以上。此外，盐碱化还对生态环境产生一定影响。