日本最好的医科大学排名是东京大学医学部。东京大学医学部是日本最顶尖的医学院之一，其学术研究水平和医疗技术水平均位于世界前列。该校拥有雄厚的师资力量和先进的实验设备，为学生提供了良好的学习和研究环境。
同时，东京大学医学部也非常注重临床实践，为学生提供了丰富的临床实习机会，帮助他们提高医疗技能和应对各种疾病的能力。
除此之外，东京大学医学部在科研成果方面也取得了不俗的成绩。许多教授和研究员在医学领域取得了重要的突破和发现，为全球的医学发展做出了贡献。
这也进一步提高了东京大学医学部在国际上的声誉和排名。
综上所述，东京大学医学部作为日本最好的医科大学之一，为学生提供了优质的教育资源和良好的学术氛围，为培养高水平的医学人才做出了贡献。