运输安全与效率、效益的关系如下：
1、安全是效率的基础
在铁路运输生产过程中，安全与生产效率是相辅相成的统一体。安全是生产效率的前提、基础和保证，生产效率寓于安全之中，没有安全，生产效率就无从谈起。一旦发生重大事故，不仅意味着人民的生命和社会劳动成果的丧失，而且也使铁路运输的具体劳动成为无效劳动。
生产效率是安全的目的，安全是实现这一目的的手段。一方面，从确保铁路运输畅通无阻、 充分发挥运输能力的角度看，安全是最基本的效率。随着铁路建设的发展，运能运量的矛盾总体上有所缓解，但在一些繁忙区域的铁路运输能力仍然严重不足，以能定运、 以能限运的情况仍然存在。
2、效率是安全的目标
运输的最终产品是人或物的位移。铁路运输需要固定资产、人力、材料、能源的大量投入。提高运输生产的效率，有利于降低运输成本，加快设备的利用效率，使铁路运输在市场竞争中更有竞争力。安全是运输的前提，只有保障运输生产的安全可靠进行，才能提高效率。
提高运输能力，降低综合成本，安全、高效是铁路运输一贯追求的目标。保障行车安全，则是提高运输能力和效率的先决条件。离开效率，片面地讲运输安全就失去了应有的意义。富有效率的运输生产，才能更好地完善和改进生产过程和生产设施，更好地强化安全。
运输安全保障措施：
1、接发列车前，车站值班员要认真确认区间空闲后方可办理闭塞，接车前必须亲自或通过有关人员确认接车线路空闲，影响进路的调车作业已停止。
2、接发列车时，严格执行行车凭证二人确认制度。
3、指示发车或发车前，要认真确认行车凭证已交付，列检作业完毕、防护信号已撤除，作业人员处于安全位置后方可指示发车或发车。
4、调车作业计划内容必须正确、齐全、清楚。没有计划、计划不清、口头传达未复诵不准作业。变更计划必须按规定停车传达清楚。
5、作业前必须彻底预检线路、道岔和停留车状况，未经预检不得作业。