那要看不愿意配合谁调查了，如果不愿意配合单位不愿意配合警察那是不允许的。
监察机关在调查处理政纪案件中相互协作配合的规定
第九条 因查处政纪案件需要，两个以上监察机关可以进行联合调查。联合调查的监察机关在调查结束后，按照有关规定各自负责处理属本监察机关职权范围内的事项。各监察机关在作出处理决定之前,应协商、通报各自的处理意见。
第十条 受委托监察机关依照委托监察机关的要求办理委托事项所产生的法律责任由委托监察机关承担；但受委托监察机关因超越委托范围或者不正确办理委托事项所产生的法律责任，由受委托监察机关承担。
扩展资料：
监察机关在调查处理政纪案件中相互协作配合的规定：
第一条 为了加强监察机关在调查处理政纪案件中相互协作配合，提高办案工作效率，根据《中华人民共和国行政监察条例》制定本规定。
第二条 监察机关查办政纪案件需要外地监察机关予以协作配合的，可以提出请求，受请求的监察机关应当依照本规定予以协作配合。
第三条 监察机关查办政纪案件需要向外地有关单位和个人调取收集证据的，可以委托当地监察机关办理。但需要采取《中华人民共和国行政监察条例》第二十一条规定第(二)、(三)、(五)、(六)、(七)项调查措施调取收集证据的，应由办案机关派员直接办理，当地监察机关应当予以协助。
参考资料来源：百度百科-监察机关在调查处理政纪案件中相互协作配合的规定
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