妊娠并发再生障碍性贫血，亦称为妊娠期再生障碍性贫血，一直以来，在治疗上，人们对是否终止妊娠有争议，但多数人认为，在妊娠早期应及时终止妊娠，如果没有自发缓解的征象，要尽早对有条件的患者行造血干细胞移植及其他免疫治疗，否则，输血次数增加会使外周造血干细胞移植成功率下降。
如患者拒绝终止妊娠，或者妊娠中、晚期发病，要尽量延长妊娠持续时间，直至能够保证胎儿存活。如果，孕妇的状况不能通过血液制品维持治疗，或病情恶化则需提前终止妊娠。孕期要根据母婴情况来决定分娩方式及时机。只有孕妇红细胞计数＞1.21012/L、血红蛋白＞35g/L，才有可能分娩正常活婴。孕晚期，要加强对胎儿的监测，有异常情况随时准备结束妊娠，结束妊娠的时机选择在孕妇血红蛋白＞70g/L，血小板计数＞50109/L以上。
分娩方式上阴道分娩优于剖宫产，前者感染和出血等并发症发生率低。当孕妇存在严重的血小板减少时，如果需要实施剖宫产，术前应予成分输血，提高血小板数目，术中准备充足血源以备急用，同时麻醉必须要充分，以避免疼痛导致的收缩压升高而引起颅内出血。