本文旨在指导如何在R语言中使用corrplot包绘制相关性热图,并进行颜色、字体等细节调整。首先,我们需要了解R语言图形细节的设置,通过R语言实战|入门3:图形初阶,基本概念将得以掌握。
我们以土壤环境因子数据为例,进行相关性分析和绘图。步骤如下:
设置工作路径并调用corrplot包。
数据读入,整理环境因子数据,行为样品名称,列为环境因子名称和分组信息。
接着,绘制相关性热图,包括:
计算相关性系数、置信区间和显著性检验。
使用corrplot绘制热图,通过设置参数method调整相关性系数可视化形式。
绘制三角形相关性热图,通过参数type设置上部或下部三角。
分别设置上部和下部可视化方法,并在一幅图中叠加。
显著性p值展示形式设置,可使用insig参数调整显著性标签显示。
置信区间展示形式设置,使用plotCI参数调整置信区间显示信息。
此外,还可以修改数值、字符形式、相关性系数可视化的颜色、设置颜色图例的放置位置,以及修改图中字体形式为Time New Roman。
最后,使用pdf()输出图片到本地时,可设置字体格式。本文提供了数据和全部代码,供读者参考和实践。