1915年，台湾爱国志士余清芳、罗俊与江定等人领导了一场以宗教为掩护的反日起义，史称“西来庵事件”。他们以西来庵为据点，活动范围遍布全台湾，并与祖国保持联系。起义于五月被暴露，罗俊被捕，随后在7月9日，余清芳与江定带领众人袭击屏东甲仙埔支厅的派出所，造成30多名日本侵略者丧命。他们转战台南，与日寇激战40余日，尽管英勇抵抗，但最终失败，余、江、罗三人壮烈牺牲。西来庵事件是日本统治期间台湾最大规模的武装抗争，主要战役发生在噍吧哖（今日台南县玉井乡）。这场起义源于余清芳等人对日本殖民统治的不满，意图建立自己的政权，因此也称为“余清芳事件”。起义原定于1915年8月（农历七月），但在5月底就被发现，6月底罗俊被捕后，起义者与江定领导的地方武装联合。参与起义的人群广泛分布于台湾各地，但主要集中在台南和高雄山区的十五个村庄，如沙仔田、芒仔芒等，这些地区地形多为丘陵和高山，居民以闽南人、客家人和平埔族为主。
从7月初开始，余清芳和江定连续发动攻击，攻击目标包括派出所和日本警民。8月初，日本军警展开反攻，在噍吧哖虎头山冲突中，起义者因装备劣势，损失惨重。日方随后在村庄和山区展开大规模搜捕，烧毁民房，造成平民伤亡。8月22日，余清芳被捕，9月23日被处以死刑。江定等人虽在逃，但殖民政府采取措施防止南化地区村民支持，迁移居民并试图通过家眷劝降。直到1916年4月，通过交涉，江定等人在9月被处决，宣告了噍吧哖事件的结束。
从起义策划到结束，前后约两年时间，共有1,957名台湾人被捕，其中1,482人被起诉，915人被判死刑，实际执行死刑的有135人，另有近300人在狱中死亡。与1930年的雾社事件相比，噍吧哖事件在起事初期的伤亡人数较少，但在持续时间、范围、动员人数、被捕和判刑人数等方面要大得多，死亡人数更是达到数千人，显示其规模之大和影响深远。
西来庵事件发生于噍吧哖（台南玉井），所以又称“噍吧哖事件”，事件主谋为余清芳，所以也称“余清芳事件”。这个事件是日治时期台湾人武装抗日事件中规模最大的一次。当时余清芳在台南市“西来庵”王爷庙假借神佛名义宣扬抗日思想，后来又认识台中人罗俊及楠梓人江定，于是共同密谋组“大明慈悲国”。宣称日本据台20年，气数已尽，余清芳受王爷神示，说中国将派大军前来支援。消息被总督府侦知，余清芳潜逃，日军入山围剿，至翌年4月事平。被捕者达1957人之多，其中866人被判死刑。在舆论压力下，四分之三的死刑犯被减刑为无期徒刑。