国家级中医特色专科、重庆市医疗特色专科。特色开展小针刀、天灸、埋线、刮痧、中药熏烤、神经阻滞、骶管注射、药氧、关节腔注射、臭氧疗法和射频消融微创技术等。
市级特色专科 重庆市医疗特色专科，重庆市优质护理服务先进病房，重庆医科大学附属第一医院、第三军医大学西南医院、大坪医院骨科指导单位，四川大学华西医院骨科协作单位。设有骨科一病区、骨科二病区、骨科三病区，特色开展经皮椎体成形术联合药物治疗老年压缩性骨折，经后路微创内固定治疗胸腰段脊柱骨折，经皮微创治疗腰椎滑脱，经后路椎间盘髓核摘除、椎间植骨融合内固定术，人工全膝关节置换术，人工肩关节置换术，关节镜手术，经皮微创治疗四肢长骨骨折，皮瓣转位治疗四肢皮肤缺失等。
重点专科建设单位 全国巾帼文明示范岗、国家危重症孕产妇监测单位、重庆市重点专科建设单位、重庆市优质护理服务先进病房、垫江县产科急救中心及妇产科技术培训单位。
妇科病区以宫腔镜、腹腔镜及经阴道微创技术为特色，常规开展各类开放性妇科各类手术，特色开展开展宫、腹腔镜下检查及癌前病变(CIN)筛查、不孕不育检查诊疗、子宫内膜息肉切除、子宫粘膜下肌瘤切除、子宫纵隔切除、子宫内膜切、宫腔异物取出、宫内节育环嵌顿取出等微创术，腹腔镜下附件手术、子宫全(次全)切除、子宫肌瘤及卵巢肿瘤挖除、宫颈癌根治、经阴道子宫切除、子宫粘膜下肌瘤切除、输卵管造口成形、输卵管复通、阴道缩窄及处女膜修补等微创技术。 产科病区以爱婴医院“儿童优先、母亲安全”为宗旨，承担全县及周边区县危急重症孕产妇救治，主要开展孕产妇常见疾病、妊娠期高血压疾病、肝内胆汁淤积症、妊娠期糖尿病、ABO(RH)溶血症监测及相关治疗，孕期及围产期保健、高危妊娠监测、难产接生、新式剖宫产、新生儿常见遗传及代谢疾病筛查、新生儿听力检测、产后康复、产后随访等。孕妇学校定期开展健康教育、心理咨询、育儿指导等。
医学检验科
重庆市重点专科建设单位，垫江县重点医学专科，重庆市青年文明号，重庆市模范职工之家，科室设常规、生化、免疫、微生物、分子生物学检验等五个亚专业组，临床基因扩增检验实验室通过卫生部技术市评审。
常规开展检验项目300余项、特殊检验项目近100项，特色开展衣原体抗原、支原体培养/药敏、D-二聚体、糖化血红蛋白(HbA1C)、超敏C反应蛋白、细菌性阴道病、性激素、血流变学、轮状病毒、肿瘤标志物等检验检测项目。优质高效为临床及患者提供及时客观的检查诊断依据。 国家级中医特色专科、重庆市“十二、五”针灸重点专科建设单位、重庆市“刺络放血治疗头痛”中医适宜技术推广培训单位，特色开展药刀松解术、全息穴位埋线、舌针、耳针、芒针、天灸、刮痧、中药贴敷、神经阻滞、骶管注射、药氧、臭氧大自血疗法。
急诊医学科
重庆市市级重点专科创建科室。由诊断区、抢救区、输液留观区和急诊监护病房(EICU)组成。负责急危重病人的抢救，可开展气管内插管机械通气，深静脉置管及肠外静脉营养技术,各类中毒专科， 抢救各类重型创伤病人、各种突发事件或大型集体中毒的抢救。“急救医疗服务体系”(EMSS)。院前急救-急诊室治疗-ICU救治。
市级特色专科建设单位 县重点学科，重庆市特色专科创建单位。消化内科重点开展消化系统疾病的专科化治疗及疑难危重症救治，含ERCP、十二指肠括约肌切开术、胆胰管取石术球囊清理术、鼻胆管引流术及支架植入术，粘膜剥离术、NBI(窄带成像)技术、胶囊内镜检查、食管胃静脉曲张套扎术、食管胃静脉曲张硬化治疗、胃恒径动脉破裂出血胃镜下结扎止血术、胃镜下食管支架植入术、食管狭窄球囊扩张及萨氏扩张术、胃镜下安置空肠营养管、胃镜下异物取出术、高频电治疗消化道息肉及腺瘤、腹水超浓缩回输、14C呼气试验检测幽门螺杆菌、金属钛夹治疗消化道出血等。
