主持完成国家自然科学基金项目4项（含国家杰青项目一项）；参加完成国家自然科学基金项目3项（含重点2项）、 科技部十一·五科技支撑计划项目（重大和重点）2项。
出版学术专著7部，译著2部，论文150余篇。发表论著被SCI收录2篇次，EI1篇次，CSCD收录它引119篇次，CSSCI收录它引101篇次。先后出席国际学术会议26次，并其中做主旨学术报告和发言17次。曾经在美国麻省理工学院、佐治亚理工大学、科罗拉多大学，英国伦敦大学、法国拉维莱特建筑学院、清华大学、北京大学、同济大学、南京大学、华南理工大学、西安建筑科技大学、哈尔滨工业大学、沈阳建筑大学、合肥工业大学、山东建筑大学、台湾大学等国内外知名大学做学术报告、数十次出任重要国际规划和建筑设计竞赛评委。
指导博士生20人（其中美、泰各1名，台湾2名，澳门1名），已答辩 8人，博士后5人、硕士生48人，已答辩37人，其中20余人的博士和硕士学位论文被推荐申报校级及以上等级的优秀学位论文。其中多篇论文已出版成书。先后四次指导本科生参加全国大学生建筑设计优秀作业评选并获奖，指导本科生获国际设计竞赛大奖一次。 1、城镇环境可持续发展与绿色城市设计，国家杰出青年科学基金，2002—2005，项目批准号：50125820
2、“发达地区小城市物质形态演变规律及其形体环境建设，国家自然科学基金青年基金，1991-1993，项目批准号：59008494
3、“基于可持续发展准则的绿色城市设计理论与方法研究”，国家自然科学基金资助项目，资助金额：1998-2000，项目批准号：59778004。
4、“后工业时代中国产业类历史建筑保护性再利用” ，国家自然科学基金资助项目，2006-2008. 项目批准号：50578040）
5、基于城市设计的大尺度城市空间形态演化机理和优化控制，国家自然科学基金资助项目，2010-2012. 项目批准号：50978052）
6、基于数字技术的城市空间规划设计方法，国家自然科学基金重点项目，董卫，王建国，王伯伟，赵冰等，2003－2006，项目批准号：50238010
7、发达地区城市化进程中建筑环境的保护与发展，国家自然科学基金重点项目，（吴良镛、齐康、陶松龄等，王在东南大学课题组排名3），项目批准号：59238150 1、国家科技支撑计划子课题：既有建筑保护技术研究（2006BAJ03A04-01）
课题负责人：王建国， 董卫、陈薇、龚恺、张宏、傅秀章、石邢、彭昌海、钱敬平、吴雁2007-2010
2、城市旧区土地节约利用关键技术研究（2006BAJ4B067）（赵万民、王建国、汤羽扬、阳建强、杨俊宴、吴晓、孙世界等），2007－2010 1 英国工程与物理科学研究院资助项目：国际研究网络：城市历史与多尺度的空间整体规划。the City History and Multi-scale Spatial Masterplanning (CHaMSpaM) , the UK Engineering and Physical Sciences Research Council，UK-China collaborative research projects, 2007-09 中方七校参与，王为东南大学负责人，2007
2 日本文部科学省科学研究费辅助金(基盘研究,海外调查A)：关于中国型居住空间规划技术的研究，合作单位：日本·京都大学，中国·东南大学，合肥工业大学，研究期间：2008.4-2011.3。宗本顺三, 项目主持，京都大学教授；东南大学合作方：王建国、钱强、张宏，唐芃、傅秀章等. 1. Urban Form and urban design: take China as an example, University of Colorado at Denver, USA . 199105
2. The Interaction between Urban Form and urban design. Georgia Institute of Technology，Atlanta, USA . 199610
3. PRESERVATION AND REVITALIZATION OF HISTORIC QUARTER IN NANJING, Second Urban Design Forum, Yokohama, Japan, Nov.19-24, 1998
4. 法国，拉维莱特建筑学院，南京城市和建筑高度形态控制，巴黎，2005
5. CONSERVATION AND ADAPTIVE-REUSE OF HISTORIC INDUSTRIAL HERITAGE IN CHINA. the International Housing Symposium. Hosted by Seoul National University of Technology, Seoul, Korea, 2005
6. DIGITALIZED MULTI-FACTORS ANALYTIC APPROACH OF THE OPTIMIZATION OF LARGE-SCALED URBAN SPATIAL FORM BASED ON URBAN DESIGN, the City History and Multi-scale Spatial Masterplanning (CHaMSpaM) international research workshop, financed by the UK Engineering and Physical Sciences Research Council, UCL, Oct.11-16, 2007, London, UK
7. ONSERVATION AND ADAPTIVE-REUSE OF HISTORIC：INDUSTRIAL BUILDINGS AND SITES:TAKE CHINA AS AN EXAMPLE，University of Colorado at Denver, 20091005)
8. MULTI-FACTORS ANALYSIS OF THE OPTIMIZATION OF LARGE-SCALED URBAN SPATIAL FORM BASED ON URBAN DESIGN，MIT，Cambridge，USA , 20091009
