明成祖朱棣在靖难之役后，确实没有废除藩镇制度，要知道明成祖朱棣在靖难之役发动的原因之一就是朝廷动了祖宗旧制，废除藩镇："太祖黄考，高皇帝，经千辛万苦，建立天下，尔后为帝，为诸侯，固族而谋，奸臣齐泰、黄子澄将其祸心藏于手，余、余、白、桂、余五弟数年而夺"，如果一继位就把诸侯都废除了，那是自讨苦吃。但是诸侯王的问题确实是一个需要解决的问题，虽然侄子搞砸了，但是他的思路是正确的，他真的想把侄子没有做好的事情做完。
傅有德
比如宁王朱权，靖难之役成功后，朱棣当然把什么"天下之中"委身给了爪哇，宁王朱权的封地从大宁迁到南昌，他的三个卫士相继被剥夺。据史料记载，在迁徙过程中，宁王朱权的三个卫士中有两个留在了北部边境戍边。"丁卯，南昌左卫对南昌卫，瀛洲左卫对隆庆左右卫，中卫对广河卫。"但从他上一次到南昌只有五六个中官到达南昌来看，他的中卫已经全部被砍掉了，"王不自安，平从兵，从五六个老中官，到南昌去。"。
朱泉
辽王朱治从边城广宁迁到荆州内地，"令辽国归荆州"，但辽王的三名卫士留在广宁，另一名卫士从荆州拨给辽王。"王自请荆州，不给一卫，故留三卫守边。"
0202、用诸侯王的罪名直接夺爵或斩其护驾。
如永乐元年（1403年），闽王朱翊因骄横跋扈，目无法纪，直接被剥夺了云南的左、中、前卫。
永乐十年（1412年），辽王朱治因罪被削去侍卫仪卫司，只给了三百人做校尉，"辽王有罪，削侍卫仪卫司给军校三百人"。
朱迪
作为周王朱棣的弟弟，朱翊不可避免地被削掉了。永乐十八年（1420年），他被诬告谋反，被召入京，虽然朱棣没有问罪，"皇帝怜惜，不再问"，但这件事无疑让周王战战兢兢，为了证明自己的清白，周王献上三名卫士，朱棣从之，"周王辞三名卫士，从之"。如齐王、顾王因反叛诸侯，直接被废为庶人。既然被废为庶民，其护卫当然就被安置在另一个地方，不复存在了。
在永乐年间，凡有战役，从不让藩王指挥，而是让宫廷侍卫听从朝廷调遣，比如在永乐四年（1406年），朝廷派西平侯穆生兴师安南，朱棣命令蜀王朱纯挑选侍卫随穆生操征调动，"知蜀王纯选兵从五千"。永乐十三年（1415年）朱棣又命周王、肃王、晋王、秦王在步实中选拔5000骑兵，由朝廷指定将领操练。
随着军权被逐步剥离，其他限制也随之而来，如禁止王令有好的分工促进劳动；诸王之间不得擅自往来，如此多的规定相继出台，随着时代的实施，更加严格，有一代地方藩王对中央完全构成不了威胁。