嗨！
建议您完整的线刷系统，刷完不要恢复系统的设置，软件慎重恢复，一般就解决了
建议您先备份您的重要数据，然后进行线刷完整包（推荐您刷到最新开发版）后再使用查看是否还有您描述的问题。
请您根据刷机教程进行刷机，其中第六种方式为线刷：http://bbs.xiaomi.cn/thread-3104435-1-1.html
同时请您下载合适的线刷包：http://bbs.xiaomi.cn/topic-mirom.html
这是米粉制作的刷机视频：http://bbs.xiaomi.cn/forum.php?mod=viewthread&tid=2742326
线刷完成后建议不要恢复系统的设置，只恢复联系人，短信，便签即可
小米手机刷机不会影响保修，您可以放心的刷机