债券回购是指债券交易的双方在进行债券交易的同时，以契约方式约定在将来某一日期以约定的价格（本金和按约定回购利率计算的利息），由债券的“卖方”（正回购方）向“买方”（逆回购方）再次购回该笔债券的交易行为。从交易发起人的角度出发，凡是抵押出债券，借入资金的交易就称为进行债券正回购；凡是主动借出资金，获取债券质押的交易就称为进行逆回购。
债券回购的方式
债券回购分为“以券融资”和“以资融券”两种方式。
1、“以券融资”，就是债券持有者在卖出一笔债券的同时，与买方约定于某一到期日再以事先约定的价格将该笔债券购回，并付一定利息。假如机构投资者选择“三天国债回购”的融资方式，交易所的交易系统将在三天后自动从其账户里划出本金和三天利息。这就是一次完整的债券回购了，简单点说就是需要钱的人拿债券作短期抵押向有钱人借钱。
2、“以资融券”则是一个逆过程。
回购的程序
一、以券融资
以券融资（卖出回购）的程序 以券融资即债券持有人将手中持有的债券作为抵押品，以一定的利率取得资金使用权的行为。 在交易所回购交易开始时其申报买卖部位为买（B）。这是因其在回购到期时反向交易中处于买 入债券的地位而确定的。回购交易申报操作类似股票交易。成交后由登记结算机构根据成交记录和有关规则进行清算交割；到期反向成交时，无须再行申报，由交易所电脑系统自动产生一条反向成交记录，登记结算机构据此进行资金和债券的清算与交割。
二、以资融券
以资融券（买入返售）的程序 以资融券即资金持有人将手中持有的资金以一定的利率借给债券持有人，获得债券抵押权，并在回购期满得到相应利息收入的行为。 在交易所回购交易开始时，其申报买卖部位为卖出（S），这是因其在回购到期时反向交易中处于卖出债券地位而定的。其交易程序除方向相反外其余均同以券融资。 对于交易对手抵押的债券，截止2012年，交易所不直接划入以资融券方证券经营机构的债券帐户，而由登记结算机构予以冻结。