公安系统的支队长是正科级，武警系统的支队长是团级。
不同部门下的支队长级别是不一样的，比如说公安系统的支队长是正科级，武警系统的支队长是团级。支队是设区的市市局的机构，刑警支队长是市局副局长级别。一般设区市是厅级，市公安局是副厅级，刑警支队长县处级。副省级城市的干部比一般的高半级，刑警支队长是副厅级。
武警序列的支队有两种情况：一般来说是正团建制，支队长为正团职务，为上校或中校；另一种是高配副师，就是由副师职干部担任正团建制单位主官，那支队长就是副师职，是大校或上校。海军序列的支队长是正师职务，比如驱逐舰支队支队长，潜艇支队支队长等。
支队长主要职责简介
1、了解和掌握支队情况，根据上级的指示和意图，适时提出军事工作的具体任务和要求，领导部属贯彻执行。
2、领导支队的战备工作，指挥全支队完成作战任务。
3、领导支队的军事训练，规定营、连的训练任务，经常进行督促检查，保证军事训练任务的完成。
4、领导部属严格执行条令、条例和规章制度，遵纪守法，严守秘密，做好安全工作，预防各种事故。
5、掌握支队的编制和实力情况，严格执行编制规定，做好装备管理工作。
以上内容参考：百度百科-支队长
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