港澳通行证用申请人本人的指纹。
关于港澳通行证的指纹信息录入，具体细节如下：
1. 港澳通行证在办理过程中，会要求申请人提供指纹信息。这是为了确保通行证的安全性和真实性。
2. 申请人需要按照工作人员的指引，将手指放置在指定的指纹采集仪器上，并按下指纹。所采集的指纹信息将与申请人的个人信息关联，并保存在通行证中。
3. 采集的指纹信息主要用于验证持证人的身份。在通关过程中，可以通过比对指纹信息来确认持证人的身份是否真实有效，提高通关效率。
因此，港澳通行证使用申请人本人的指纹，旨在确保通行证的安全性和身份认证的真实性。