1、定义不同
鸡：鸡是一种家禽，家鸡源出于野生的原鸡，其驯化历史至少约4000年，但直到1800年前后鸡肉和鸡蛋才成为大量生产的商品。鸡的种类有火鸡、乌鸡、野鸡等。而且鸡也是12生肖中的一属。
鸭：鸭是雁形目鸭科（Anatidae）鸭亚科（Anatinae）水禽的统称，或称真鸭。鸭的体型相对较小，颈短，一些属的嘴要大些。腿位于身体后方（如同天鹅一样），因而步态蹒跚。
2、形态特征不同
鸡：雉鸡是鸡形目雉科雉属的1种。又名野鸡，山鸡，雉，环颈雉，项圈野鸡。在中国，除青藏高原的大部分以外，分布遍于全国。体长90～100厘米米。雄鸟羽色华丽。在华东所见的雉鸡，头顶黄铜色，两侧有白色眉纹。
颏、喉、后颈均黑，有金属反光。颈下有一显着的白圈，所以通称为环颈雉。背部前为金黄色，向后转栗红，再后为橄榄绿，均具斑杂。尾羽甚长，主为黄褐色，而横贯以一系列的黑斑。
鸭：肉用鸭，大，体躯宽厚，肌肉丰满，肉质鲜美，性情温顺，行动迟钝。早期生长快，容易肥育。有代表性的有北京鸭、樱桃谷鸭、法国番鸭、奥白星鸭等。
比较适应市场的以法国番鸭、奥白星鸭等看好，突出的特点有肉质好、瘦肉率高、料肉比低，抗病力强。如法国番鸭其肉质具野禽风味；胸腿肌占胴体27～30%；在粗放条件下，育雏率和成活率高达95～98%。
蛋用鸭，较小，体躯细长，羽毛紧密，行动灵活，性成熟早，产蛋量多，但蛋型小，肉质稍差。比较有代表性的有金定鸭、绍兴鸭、高邮鸭等。福建的金定鸭，年产蛋260～300枚，蛋重60～80克，其次是产于浙江的绍兴鸭和江苏的高邮鸭，其产蛋量亦在250枚左右。
鸡
鸭
3、营养价值不同
鸡：鸡肉味道鲜美且有营养。鸡的营养物质大部分为蛋白质和脂肪，但鸡肉中欠缺钙、铁、胡萝卜素、硫胺素、核黄素、尼克酸以及各种维生素和粗纤维，如果长期将鸡肉当做主食食用且不摄入其他瓜果蔬菜及粮食易导致身体亚健康。
鸭：鸭肉的营养价值与鸡肉相仿。但在中医看来，鸭子吃的食物多为水生物，故其肉性味甘、寒，入肺胃肾经，有滋补、养胃、补肾、除痨热骨蒸、消水肿、止热痢、止咳化痰等作用。
参考资料来源：百度百科-鸡
参考资料来源：百度百科-鸭