刚经历过一次，从申请到拿到证件花了两天时间，共需要花费685元港币。现将有关信息告知如下，希望对大家可以有帮助！
1、发现港澳通行证丢失后，请即刻到就近的警署报备。在此，建议最好事先留存港澳通行证正反两面的照片，这个在备案的时候有很大的帮助。曾看到警署开出来的证明材料并不是遗失港澳通行证的证明，导致当事人在办理的时候需要重新去警署证明。
2、准备两张中国签证（chinese visa size）证件照尺寸的近期免冠照片，香港有一些自助拍照的机器或者门面，均可以考虑。一般选用白底。
3、在网站上网页链接下载有关表格并填写信息。根据网站列出的材料准备相关材料。建议都相应准备有关复印件。
4、上述材料准备好以后就可以去中国外交部驻香港公署领事部（香港湾仔港湾道26号华润大厦4楼）申请办理了办公时间：星期一至星期五 上午9：00―12：00;下午 2：00―5：00 香港公共假期不办公。建议早上八点半左右就到一楼排队，直接在中国公民领证那个指示牌那边。之前看到有关帖子（特别感谢这个帖子，出自“娱乐看人生”百家号）说在此处办理当天就可以拿证。我们去的时候，工作人员明确告知现在已经无法当天出证，只能第二天发证。次日，先到四楼申请处划价，然后到三楼人民银行窗口（只接受港币纸币现金）缴费。随后再去四楼领证处领证即可。
5、领到临时通行证后，还有关键的一步，需要前往“香港出入境中心办理签证”办理签注。此时也需要排号，办理需要等待约30-45分钟左右。约谈（当事人若未满18岁，需同时面谈陪同人员）后到同层楼另一个大厅等待证件发放。
鉴于参考好友推荐的帖子暨“娱乐看人生”的“在香港丢了通行证，不用去港中旅，这个地方申领更方便！”，本次办证非常顺利。由于帖子中的主人公人品开挂，亲自操作时略有出入，因此在此留言。希望可以帮到类似情况的朋友！同时特别感谢在港的好友及博主！
流程方面，当事人遗失后应在第一时间前往就近警署报失，并凭报失证明亲临香港中国旅行社办理手续。
申请时须提交以下资料：
1、提供香港警署报失证明；
2、提交完整填写并由本人签名的《中华人民共和国入出境通行证申请表》，表格在中旅社直接领取；
3、交验申请人相关带相片的身份证明文件，例如：居民身份证、原《港澳通行证》的复印件、户口簿；如属损坏须交验原持《港澳通行证》及签注，提交复印件各一份；
4、提交本人彩色照片2张；
5、领取临时通行证后，还须亲往地处湾仔的香港入境事务处办理离境手续(确认在港逗留期限)后方可离港。
领取证件时，当事人按取证时间持回执单到香港中国旅行社领取一次性有效出入境通行证返回内地。当事人在香港领取证件后，还需前往香港入境事务处办理相关离境手续。需要注意的是，在香港申请办理证件期间，如可能逾期逗留的，当事人也需向香港入境事务处办理逗留延期备案手续。香港中国旅行社在上环、旺角、荃湾、屯门等地均有服务点，具体地址、营业时间及收费标准可向香港中国旅行社咨询。本回答被提问者和网友采纳