商水县商务局作为商水县政府的重要组成部分，承担着全面管理全县范围内国内外贸易、推动国际经济合作以及促进内外招商投资等关键任务。该机构于2005年4月正式成立，机构设置严密，拥有11个专门负责不同领域的职能股室：
办公室：负责日常行政管理和协调工作。
人事教育股：关注员工的招聘、培训和人事管理。
综合信息与对外开放股：处理与信息交流和对外开放政策相关事务。
规划财务股：负责局内的财务规划和预算管理。
世贸组织与公平贸易股：致力于国际贸易规则的研究和公平贸易实践。
机电产品进出口股：专门负责机电产品的进出口业务。
市场体系建设股：推动市场体系的建设和优化。
商业改革发展股：关注行业改革与商业发展政策的制定和实施。
市场运行监督调节股：确保市场运行的规范和秩序。
内外商投资促进管理股：积极吸引和管理内外投资者。
对外经济合作股：负责对外经济合作项目的规划与执行。
此外，县商务局还直接管辖着四个直属单位：
商水县整顿和规范市场经济秩序工作领导组办公室：维护市场秩序，确保公平竞争。
商水县外、台商投诉中心：为外商提供问题解决和投诉处理平台。
商水县畜禽屠宰管理稽查大队：监督和管理畜牧业相关行业。
商水县室内装饰行业管理办公室：负责室内装饰行业的规范与管理。
这些部门共同构成了商水县商务局的坚实架构，致力于推动当地经济的繁荣和发展。