制药工程专业就业方向有如下这些：
学生毕业后可到制药工程（或医药生物技术）领域相关的生产企业、营销企业、科研院所、药品监督管理部门等企、事业单位从事药品生产、管理、营销、检验监督和研发等企事业单位工作。
制药工程专业主要就业领域包括：药品的创新性研究和新产品开发；国内外制药新技术的转化、使其地方化、产业化；产品进行技术改造、工艺研究、质量控制等；报考生物技术、药学及相关专业的研究生。
1.研发人员——在药厂、大学、研究所的研究部门，从事药物研发工作；
2.生产、技术人员——在药厂，从事药品生产、技术工作；
3.质检化验人员——在药厂、食品厂、药检所，从事食品药品质检化验工作；
4.管理人员——在药厂，从事药物的生产技术的管理等工作；
5.营销人员——在药厂、医药营销公司，从事药品营销、内勤等工作；
6.药剂师——在医院药剂科，从事制剂、质检、临床药学等工作；在药店、医药营销公司，从事药品使用指导咨询等工作；
7.药检人员——在药检所从事药物的质量鉴定和制定相应的质量标准；
8.公司职员——在医药贸易公司或制药企业从事药品流通及国内外贸易。
9.药品监督人员——公务员，在国家、省、市、县药品监督局，从事食品药品质量监督等工作；
10.自创公司。
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