在现实的社会经济中，公司选择成为小规模纳税人还是一般纳税人，需要根据实际情况做出合理选择。但是，应该注意的是，在发展客户方面，一般纳税人比小规模纳税人更具优势。
二者存在以下不同：
1、认证标准不同。《新政》实施后，中国增值税小规模纳税人标准被调整为年销售额500万元及以下的增值税，一般纳税人不同于小规模纳税人。但是，应该指出的是，该公司不符合认证标准，但希望该公司开发、，并在招标中具有优势，或者将来与大型公司开展业务，或者申请成为通用纳税人。
2、适用的税率不同。目前，一般纳税人的税率分为6％、 9％、 13％，而小规模纳税人，商业企业、工业企业的统一税率为3％（不包括免税）。
3、所需条件不同。通常情况下，小规模纳税人的会计核算不健全，政策要求也很广泛。一般纳税人企业，必须具备以下条件：有固定的生产经营场所；可以按照国家统一会计制度设置账簿；根据合法的、有效的，它可以提供准确的纳税信息。
4、收到增值税专用发票后，两个帐户不同。一般而言，纳税人按金额支付，税款部分计入“应交税额–应交增值税–进项税额”；小型纳税人已计入全部费用。
5、使用发票有所不同。在日常业务活动中，小规模纳税人和一般纳税人使用的发票也有所不同。小规模纳税人只能使用一般发票进行销售，而不能开具增值税专用发票。如果遇到特殊增值税发票的要求，则必须去税务局开立3％的特殊增值税发票。一般纳税人可以开具一般发票或增值税专用发票，一般纳税人取得的增值税专用发票可以用于抵扣。
6、税收政策不同。一般纳税人和小规模纳税人之间的差异也反映在税收政策中。小型纳税人的增值税率为3％。小规模纳税人通常每季度报告一次。与一般纳税人不同，他们的纳税申报表是按月进行的。
7、计税方法不同。一般而言，纳税人按照“抵扣制度”计算税额，即减收后的余额按余额支付；小规模纳税人通过将销售收入除以金额（1+适用税率）然后乘以税率来计算应纳税额。