拿上海E-研究院来说
为了加强基础理论研究，培养和吸引一批学科带头人，上海市教委在科研机制和科研管理上进行了创新性的探索。
传统的R&D组织形式由于空间和地域的分散使智力、技术及信息等资源的共享受到很大的制约，同时也降低了R&D组织的运作效率。随着信息网络技术的迅猛发展，时空的障碍被打破，虚拟研发组织（Virtual R&D Organization）也应运而生。所谓虚拟研发组织，又称为动态研发联盟或创新网络，是R&D活动中形成的一种新的组织形式，是围绕特定研发目标和内容，利用计算机网络等通讯工具建立起来的联盟组织。虚拟R&D组织的概念、相关理论及实践活动受到国内外的广泛重视，由英国率先提出的E-Science就是对科学研究的信息化过程，是基于虚拟R&D组织进行的科学研究工作。上海市教委于2002年底启动实施了上海高校E-研究院建设计划，在高校虚拟R&D组织的建设方面进行了一系列探索和实践，产生了很好的反响和成效。
上海高校E-研究院建设目标是稳定一批基础理论研究和人文社会科学研究的中青年学术骨干；整合优化相关领域的科技资源和队伍；加强不同学科的交叉融合；加强学校间联合；加强与国内外高校与科研机构的合作与交流；增强上海高校科技的原创能力和持续创新能力，从而带动上海高校的整体发展。争取在若干年内，涌现一批优秀的学科带头人，并引领一批学科进入国内领先和国际先进水平，使之成为上海重要的人才高地和科技创新的高地。
上海高校E-研究院是以信息化基础设施为依托；以跨学科、跨地域合作为特点；以汇聚人才，培育人才，上水平，出成果为目的的自然科学基础性研究和人文社会科学研究基地。根据基础性研究，特别是人文社会科学研究的特点，E－研究院在制度设计上重点突出了以下的特征：
（一）重点突出共享性、开放性和协同性。共享性是指在E化环境下实现人力资源、计算资源、数据资源、网络通信资源以及仪器设备等资源的全面共享；开放性是指整个科研活动的展开，包括项目与成果的申报与承担，队伍的培养等打破原先组织方式，开展跨地区、跨学科的科研合作，使之具有开放性；协同性是指在E化环境中，满足科学家之间交流与协作的需要，使分布在全国各地、甚至世界各地的科学家能方便地开展协同工作，共同解决所关心的科学难题。
（二）重点突出体制机制创新。上海高校E-研究院建设旨在探索管理体制与运行机制上的创新，实行首席研究员负责制，以首席研究员为第一责任人，与市教委签订E－研究院建设项目任务书，全面履行E－研究院管理职责。首席研究员的职责是：确定E－研究院的研究方向，制订和执行E－研究院的发展规划和工作计划；制订特聘研究员聘用条件和节点考核目标；组织对外合作和举办高层次的学术会议；统筹安排E－研究院建设经费和配套经费，并组织争取各级、各类科研课题，拓展E－研究院的经费渠道等。
（三）重点突出考核评价体系的改革。在建设周期内，市教委将对E－研究院进行3年、3年、4年节点考核（简称“3+3+4”），节点考核主要是对制定的目标任务完成情况进行评价，注重对特聘研究员学术产出的原创性和质量的考察。每次节点考核后，根据考核结果对各E－研究院的投入进行动态调整，成效显著的将提高平均资助强度；完成考核目标的将继续给予支持；未能完成考核目标的将采取暂缓资助、取消资助、摘牌等措施。在建立以上考核方式的同时，上海市教委给予长达十年的经费资助。
另外，采取研究成果双标注的方式；建设经费实行动态跟踪、滚动支持；营造宽松、自由的学术氛围等管理办法都使E-研究院这一新型的高校科研组织形式产生了新的活力，促进了学科持续、稳定、健康地发展。
上海高校E-研究院建设主要依托市属高校。本着“成熟一个启动一个”的原则，迄今已建设四个人文社科的E－研究院包括：社会学、都市文化、音乐人类学和比较语言学。这些E-研究院主要分布在上海大学、上海师范大学、上海音乐学院等高校。
各E-研究院经过一段时期的建设，已取得了一定的进展和初步成效：
1、形成了以学科为聚焦的研究团队。已聘请了48位特聘研究员，其中国外研究员3位，外省市研究员17位，上海市非依托学校研究员11位，本校研究员17位。
2、规划内的研究工作进展顺利。据不完全统计，新承担各级各类研究项目共46项，获研究经费共791.5万元。其中承担国家哲学社会科学基金项目15项，经费285万元；承担省市部委级项目共6项，经费71.5万元；承担企事业单位合作、委托项目共20项，经费300万元；承担国际合作项目共5项，经费135万元。特聘研究员共有105篇按要求署名的论文发表，其中在国外发表4篇，被SSCI收录12篇。特聘研究员已出版著作9部，其中专著8部；撰写研究报告并提交有关部门10份。
3、加强了对信息化设施的建设，建立了视频会议系统及网站等。
4、开展学术交流活动，加强信息交流。主持举办了多次国内外学术会议、系列及专题讲座、特聘研究员学术研讨等。
5、E-研究院的校外特聘研究员还为所依托学校培养博士研究生，充实了依托学校高层次人才培养的力量。
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