治疗脑囊虫，推荐以下医院：
1. 北京天坛医院
北京天坛医院在神经系统疾病的诊治方面享有盛誉，其神经内科及神经外科均具备深厚的专业底蕴和丰富的临床经验。对于脑囊虫这类神经系统寄生虫疾病，天坛医院拥有先进的诊疗设备和资深的专家团队，能给予患者最佳的治疗方案。
2. 上海华山医院
上海华山医院神经科在国内外享有很高的声誉，其对于各类神经系统疾病的诊断与治疗都有丰富的经验。脑囊虫治疗方面，华山医院有专门的团队进行深入研究和治疗，并且采用最新的诊疗技术，取得显著的治疗效果。
详细解释：
1. 医院的专业优势：上述推荐的两家医院，均在神经系统疾病的诊治领域具有极高的权威性和丰富的经验。它们拥有资深的专家团队、先进的诊疗设备和完备的治疗技术，能够为脑囊虫病患者提供全方位、专业化的诊疗服务。
2. 脑囊虫病的复杂性：脑囊虫病是一种复杂的神经系统寄生虫病，需要专业的神经科医生进行诊断和治疗。因此，选择有丰富经验和专业技术的医院至关重要。
3. 医院的综合实力：上述推荐的医院不仅在神经内科和神经外科方面有着卓越的表现，而且在医院的综合实力、科研水平、服务质量等方面也都属于国内一流。这意味着患者在接受治疗的同时，也能享受到高品质的医疗服务和护理。
综上所述，北京天坛医院和上海华山医院是治疗脑囊虫的推荐医院。患者在选择时，还可以根据自身情况、地理位置等因素进行综合考虑。