主要区别有，生物种类不同、形态特征不同、生活习性不同，具体如下：
一、生物种类不同
1、石鳖
石鳖，属于软体动物门、多板纲中原始类型的贝类，是海洋浮游生物重要组成之一。
2、鳖
鳖，又称甲鱼、水鱼、团鱼、老鳖、王八、泥龟等，属龟鳖目、鳖科、鳖属、鳖种的水陆两栖的卵生爬行动物 。
3、龟
龟，别称乌龟、金龟、草龟、泥龟和山龟等。属龟鳖目、龟科、乌龟属、乌龟种的水陆两栖的卵生爬行动物 。
二、形态特征不同
1、石鳖
颜色和岩石一样，形状有点像陆地上的潮虫。通常呈卵圆形，扁平，两侧对称。贝壳由8块壳板覆瓦状排列而组成。贝壳周围有一圈外套膜，又称环带。足扁而宽，几占整个身体腹面，适于吸附在岩石表面或匍匐爬行。
2、鳖
其头像龟，但背甲没有乌龟般的条纹，边缘有软状裙边，壳要比乌龟的软。颜色墨绿。外形呈椭圆形，比龟更扁平，它的背腹甲上着生柔软的外膜，周围是细腻的裙边，头颈和四肢可以伸缩，肢各生五爪，爬行敏捷，从外形颜色观察，甲鱼通常背脊和四肢呈暗绿色，有的背面浅褐色，腹面白里透红。
3、龟
背甲较平扁。有3条纵棱，雄性成体棱弱。每一盾片均有黑褐色大斑块，有时腹甲几乎全被黑褐色斑块所占，仅在缝线处呈现棕黄色。头部橄榄色或黑褐色；头侧及咽喉部有暗色镶边的黄纹及黄斑，并向后延伸至颈部，雄性不明显。四肢灰褐色。
三、生活习性不同
1、石鳖
石鳖体柔软，伸屈性大，能紧贴在石缝内，不依附他物时能卷成球状。在石上贴附极牢，强行撬下可使之受伤。多见于潮间带或浅水中(尤其是温暖地区)。较冷的地区生活于深水中，直到4，000公尺(13，000呎)深处。多数夜行性。幼体(担轮幼体)自由生活，数量极多，它爬行的速度很慢，多半在夜间才行动。如果有足够的食物供应，它们可以在一个定点停留很长时期。
2、鳖
甲鱼喜欢栖息于水质清洁的江河、湖泊、水库、池塘等水域，甲鱼生性凶猛好斗，群体间侍强凌弱现象很普遍，食物缺乏时会残食同类。喜食动物性饵料。幼鳖以水生昆虫、水蚯蚓、蝌蚪、小虾等为食。成鳖摄食田螺类，蛤蜊等软体动物、鱼、虾以及动物尸体(因追不到鱼)，也食蔬菜、水果、杂粮等植物性饲料。
3、龟
常栖于江河，湖沼或池塘中。身上长有非常坚固的甲壳，受袭击时龟可以把头、尾及四肢缩回龟壳内。大多数龟均为肉食性，以蠕虫、螺类、虾及小鱼等为食，亦食植物的茎叶。
参考资料来源：百度百科-石鳖
参考资料来源：百度百科-龟类
参考资料来源：百度百科-乌龟
参考资料来源：百度百科-鳖
参考资料来源：百度百科-甲鱼