不会留下案底记录。
案底通常指的是公安机关、法院等司法机关在处理刑事案件过程中，对犯罪嫌疑人的相关信息进行登记、保存所形成的记录。而检察院在审查起诉阶段，如果认为犯罪嫌疑人的行为不构成犯罪或犯罪情节轻微不需要起诉，会作出不起诉决定，这一决定本身并不会形成案底记录。
一、检察院不起诉决定的含义与性质
检察院不起诉决定是指在刑事诉讼过程中，检察院经过审查认为犯罪嫌疑人的行为不构成犯罪或者犯罪情节轻微，不需要追究刑事责任，或者证据不足、不符合起诉条件，从而决定不向法院提起公诉的一种诉讼活动。这一决定是检察院依法行使公诉权的结果，具有法律效力。
二、案底记录的形成与保存
案底记录通常是由公安机关、法院等司法机关在处理刑事案件过程中形成的。这些机关在侦查、审判等阶段，会对犯罪嫌疑人的身份信息、犯罪事实、证据材料等进行登记、保存，形成案底记录。这些记录对于维护社会治安、打击犯罪具有重要意义。
三、检察院不起诉与案底记录的关系
检察院在作出不起诉决定时，并不会形成案底记录。因为不起诉决定本身并不涉及对犯罪嫌疑人的定罪量刑，而是对案件是否提起公诉的一种判断。因此，即使检察院作出了不起诉决定，也不会在相关机关留下案底记录。
然而，需要注意的是，虽然检察院不起诉不会留下案底记录，但相关案件材料仍会保存在检察机关的档案中。这些材料可能包括案件审查报告、证据材料、不起诉决定书等。这些档案材料对于检察机关进行内部监督、总结经验教训等方面具有重要作用。
综上所述：
检察院在决定不起诉时，并不会留下案底记录。但相关案件材料会保存在检察机关的档案中。这些档案材料对于检察机关内部监督和总结经验教训具有重要意义。同时，公众也应正确理解检察院不起诉决定的性质和意义，避免误解和误导。
法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》
第一百七十七条规定：
犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十六条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。
对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。
人民检察院决定不起诉的案件，应当同时对侦查中查封、扣押、冻结的财物解除查封、扣押、冻结。对被不起诉人需要给予行政处罚、处分或者需要没收其违法所得的，人民检察院应当提出检察意见，移送有关主管机关处理。有关主管机关应当将处理结果及时通知人民检察院。
《中华人民共和国人民检察院组织法》
第二十一条规定：
人民检察院行使下列职权：……（二）进行侦查，对刑事案件审查决定是否逮捕、起诉或者不起诉；
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