区别1、组织构成基础不同
大学社团大致是指有着共同兴趣爱好的同学们共同建立的组织，是为了发挥某一共同具体特长一般也是靠学生之间的感情维系的组织。 与之相较学生会就显得组织内部更严谨，对于人才的选拔及安排岗位也都有严格的制度。不分年级、系科甚至学校的界限，由兴趣爱好相近的同学组成。
在保证学生完成学习任务和不影响学校正常教学秩序的前提下开展各种活动。学生在自愿基础上结成的各种群众性文化、艺术、学术团体。
大学学生会学生会（Student Union）是中国中等和高等学校学生的群众组织。
区别2、建立目的不同
学生会加强学生会建设的目标和主要任务是：学生会全体人员的思想道德素质得到有效提高，良好道德风尚、和谐人际关系进一步形成，内部更趋团结，精诚合作；学生会内外制度更趋完善，依法治理的方略基本得到落实，公平公正得到切实保障；
学生社团目的是活跃学校学习空气，提高学生自治能力，丰富课余生活；交流思想，切磋技艺，互相启迪，增进友谊。种类很多，如各种学术、社会问题研究会，文艺社、棋艺社、影视评论社、摄影社、美工社、篆刻社、歌咏队、剧团、篮球队、足球队、信息社等
区别3、起源不同
学生会起源于清华于1919年12月23日成立了第一个学生会，它诞生于“五四”运动爱国、民主、科学的洪流中。此前清华学校初期，还没有全校性学生会组织。清华学生会初期的组织形式模拟的是资产阶级议会政治，即“三权鼎立”。
评议会是全校代议机构，行使立法权；干事部行使行政权；司法的权力还掌握在学校斋务处手中。随着“五四”以来新思潮对学生影响的增长，学生们对于校方家长式的严厉管束越来越不满。
学生社团，在中国，高校学生社团已有一百多年的历史。1904年，我国成立了第一个严格意义上的大学生社团是京师大学堂的抗俄铁血会，当时的青年学生可以通过集会、演讲、办报、发传单等方式抗议日本、俄国在我国东北发动战争。
参考资料来源：百度百科-学生会
参考资料来源：百度百科-学生社团
学生社团是指学生为了实现会员的共同意愿和满足个人兴趣爱好的需求、自愿组成的、按照其章程开展活动的群众性学生组织。学生社团是我国校园文化建设的重要载体，是中国高校第二课堂的引领者。