附中办学经历了两次搬迁。附中最早的办学地址在大学的学生活动中心,1985年搬迁到羊城苑,1990年在搬迁到校址。
附中第一届招生时有38人报名,正式开学时却来了64人,许多学生是从113中学和47中学转回。当时教职工有8人,其中行政3人,教师5人。首任校长是李辉利。第二次迁址后学校扩大至三个年级八个班。1998年创办了高中,成为一所完全中学。
学校办学初期条件比较简陋,许多房子都是用木板间隔而成,学生活动场地也比较小,做课间操都要隔天安排才能进行。首任校长李辉利曾在海南教学22年,据他回忆,当时办学虽然条件简陋,教学压力大,教师们依然是兢兢业业,无怨无悔。教师的辛勤劳动也结出了丰硕的果实:每年都有20来人考上华南师范大学附中等省重点学校。
在大学领导的重视和支持下,20多年来附中实现了跨越性的发展,办学条件和教学设施获得极大改善:现附中有着功能齐全的校园网,初、高中部每个教室都装备有先进的液晶投影仪、实物展示台、HP台式电脑等多媒体电教教学设备,为提高教育教学质量提供了现代化的技术条件。