洁净棚的洁净度往往受到气流的影响，换言之，即人、机器隔间、建筑结构等所产生的尘埃之移动、扩散受到气流的支配。
洁净室系利用HEPA、ULPA过滤空气，其尘埃的收集率达99.97~99.99995%之多，因此经过此过滤器过滤的空气可说十分干净。然而洁净室内除了人以外，尚有机器等之发尘源，这些发生的尘埃一旦扩散，即无法保持洁净空间，因此必须利用气流将发生的尘埃迅速排出室外。 洁净棚内的气流是左右洁净室性能的重要因素，一般洁净室的气流速度是选0.25~0.5m/s之间，此气流速度属微风区域，易受人、机器等的动作而干扰趋于混乱、虽提高风速可抑制此一扰乱之影响而保持洁净度、但因风速的提高，将影响运转成本的增加，所以应在满足要求的洁净度水准之时，能以最适当的风速供应，以达到适当的风速供应以达到经济性效果。
另一方面欲达到洁净室洁净度之稳定效果，均一气流之保持亦为一重要因素，均一气流若无法保持，表示风速有异，特别是在壁面，气流会延着壁面发生涡流作用，此时要实现高洁净度事实上很困难。
垂直层流式方向要保持均一气流必须：(a)吹出面的风速不可有速度上的差异；(b)地板回风板吸入面之风速不可有速度上的差异。速度过低或过高(0.2m/s，0.7m/s)均有涡流之现象发生，而0.5m/s之速度，气流则较均一，一般洁净室，其风速均取在0.25~0.5m/s之间。 影响洁净棚的气流因素很多，如制程设备、人员、洁净室组装材、照明器具等，同时对于生产设备上方气流的分流点，亦应列入考虑因素。
一般操作台或生产设备等表面的气流分流点，应设于洁净室空间与隔墙板间距2/3之处，如此可使作业人员工作时，气流可从制程区内部流向作业区，而将微尘带走；若分流点配置在制程区前方，将成为不当的气流分流，此时大部份的气流将流至制程区之后，作业员操作所引起的尘埃将被带到设备后面，工作台因而将受到污染，良率也势必降低。
洁净室内的工作桌等障碍物，在相接处均会有涡流现象发生，相对地在其附近之洁净度将会较差，在工作桌面钻上回风孔，将使涡流现象减少最低；组装材料之选择是否恰当、设备布局是否完善，亦为气流是否成为涡流现象之重要因素。
风机从FFU顶部将空气吸入，经初效过滤器，高效过滤器过滤，过滤后的洁净空气在整个出风面以0.45m/s±20%的风速匀速送出到洁净棚内。形成均流层，使洁净空气气流呈垂直单向流，从而保证了工作区内所要求的洁净度。
洁净棚是能快速组建的简易洁净室,其具有安装快速、施工周期短、价格低廉、移动方便等特点，把主要生产工序控制在较小的环境内也是洁净室设计的最佳选择。
首先，适用的面积不一样。如果面积大于500㎡，建议选用传统的洁净室工程，如果在100-500㎡之间，模块化洁净室（无尘室）最合适。如果是100㎡以下，选择模块化洁净室和洁净棚都可以。洁净工程一般单独使用，模块化洁净室可单独使用，也可配合建造在大的生产车间里。洁净棚则一般是配合大的洁净室内使用，以满足局部高洁净度的要求。
其次，从造价成本上看，洁净棚是相对比较便宜的。洁净棚框架简单，一般采用工业铝材（或不锈钢方通、铁方通喷塑），四周用防静电挂帘或栅帘。洁净棚没有独立的空调送风系统，风机滤网机组FFU也不会过多，一般没有单独的初中效过滤器，如果不配合大的洁净室（无尘室）使用，高效过滤器使用寿命会大大降低，无形中增加成本。
第三，施工周期不同。洁净室工程需要时间较长，模块化洁净室（无尘室）一般需要3-5天，现场不用切割加工，不影响生产，也不产生施工垃圾。洁净棚因结构简单，施工周期同样很短。
第四，从材料的重复利用率来看，模块化洁净室（无尘室）材料的重复利用率高，改造时，除了密封胶以及一些易损易耗品需要更换外，其他材料均可重复利用。这一点来看，模块化洁净室完胜。
第五，外观的通透性、美观度来看，模块化洁净室（无尘室）四周采用大幅中空玻璃视窗，视觉比传统洁净室工程更加通透明亮，材质和表面处理更精细，外观现代简约大方，提升了作业人员的幸福感。
第六，从密闭效果、安全性能上来看，模块化洁净室（无尘室）和洁净室工程要比洁净棚更好。
以上是模块化洁净室、洁净工程与洁净棚的比较，希望能对您有所帮助。