我司香港公司付款给供应商，但实际由供应商名义报关，流程错了，公司财务要货物发票，如何操作？

Question

我是新人，对这方面不太懂，请教各位前辈。

我司采购了一台仪器（测量仪器），本来流程应该是我司向我香港公司采购，再由我香港公司向供应商采购。
如果依照本流程，应该是我上海公司找进出口公司，付款给进出口公司，再由进出口公司付美金给香港公司，完了香港那边则是香港公司付款给供应商，采购后以我香港公司的名义做装箱单及发票进来，以我香港公司名义出货报关对吧？

可当时我司账上钱不够，而直接由我香港公司直接付款给了供应商。最后出货的时候，是直接由供应商的名义直接出货报关，CIP上海的。

当时进出口公司有增值税、关税的单子给我们，我们好进行增值税抵扣。

现在公司财务要求，这笔单子，应该有供应商给我们的发票之类。
可是我们本来是想由我香港公司出货的啊，现在怎么办？
如果是这样的话，我可以自己香港公司出发票给上海公司留存么？还有，如果按照原有意愿，是否上海公司还欠我香港公司这笔货款？
但是因为报关的时候是直接由供应商名义出货报关的，现在就不知道怎么办了？

请教各位前辈！！跪谢！！

Answer 1

你货物实际报关时显示流程是你境内公司直接向供应商购买，与香港公司无任何关联。所以你报关合同发票类应该都是与供应商直接发生的。你公司付款也应该直接付款给境外供应商，才导致你境内公司无法付款或者入账，更别提增值税抵扣了。你这种做法无论海关还是税务来看都是一种违规行为，处理起来比较难。建议你与供应商沟通，通过供应商与香港公司款项往来调整账目。

Answer 2

要进口的税票是以你们公司进口的是可以抵扣的追问

谢谢您的答复，我的意思是，是以上海公司进口的，所以开的增票我们是可以抵扣的。
现在的问题是，总归会有形式发票或销售发票吧，本应该是香港公司开出形式发票的。可进口报关是供应商直接开给上海公司的，根本就没有香港公司的事儿。但款是由香港公司打给供应商的，上海公司本应打给香港公司的。现在上海公司财务要货物的形式发票等留存，该是由谁来开？