1、工作职能不同
司法局是负责本市司法行政工作的市政府组成部门，其主要职责是：
(一)研究起草司法行政方面的地方性法规、规章草案；编制本市司法行政工作的发展规划及年度计划，并监督实施。
(二)负责组织、指导对刑满释放和解除劳动教养人员的安置帮教工作。
(三)负责本市司法行政系统的队伍建设和思想政治工作。
(四)研究制订本市法制宣传教育工作的总体规划，组织、指导、协调全市法制宣传教育工作。
(五)负责管理本市律师、法律援助工作和公证机构及公证活动；研究律师、公证工作的改革与发展，并提出实施办法。
(六)负责管理本市法律服务机构和在京设立的国(境)外律师机构；监督、指导本系统的社会团体工作。
(七)指导本系统法学教育及业务培训工作。
(八)负责指导区、县司法行政部门管理人民调解工作、社区矫正工作及司法助理员、基层司法所和基层法律服务工作。
(九)负责本市司法行政系统的外事工作和对外宣传、交流工作。
(十)指导和管理本市面向社会服务的司法鉴定工作。
(十一)负责本市仲裁机构的登记管理工作。
(十二）负责本市国家司法考试工作。
(十三）负责社区矫正工作
(十四)承办市政府交办的其他事项。
公安局工作职责
（一）按照县委、县政府和上级公安机关的指示，研究部署县公安工作，并指导和督促检查全县各部门贯彻执行情况。
（二）及时准确地掌握全县社会治安情况，分析、研究出现的新情况、新问题，为县委、县政府和上级公安机关提供社会治安方面的重要信息，并提出对策。
（三）负责全县各部门公安机关的业务工作和执法活动。
（四）组织、协调、参与或直接对全县重大案件、重大紧急治安事件、重大治安灾害事故的侦破和处置，以及对特务、间谍等危害国家安全的案件的侦破。
（五）负责全县依法管理社会治安、户籍、居民身份证、外国人管理和出入境工作；加强法制建设；组织、实施、监督消防工作
（六）领导、参与或直接侦破走私、制造、贩卖、运输毒品的犯罪案件，并组织抓好禁种、禁吸毒品工作。
（七）负责全县看守所、拘留所、戒毒所、收容教育所的管理与执法活动。
（八）负责全县公安机关依法监督机关、团体、企事业单位的安全保卫工作，指导企事业单位保卫组织的建设和业务的开展；指导或直接组织实施对党和国家领导人及重要外宾的安全警卫任务、大型活动的安全保卫工作。
（九）负责全县公安机关的技术侦察、信息通信、公共网络安全监察和科学技术工作，规划公安装备现代化建设。
（十）为全县公安机关提供信息、技术、后勤装备等服务工作
（十一）负责全县公安政治工作、纪律检查工作、行政监察工作、审计监督工作、警务督察工作，规划、指导和管理全县公安队伍的革命化、正规化建设及公安民警的教育培训工作
（十二）领导现役鲁甸消防大队工作；领导全县公安消防工作，指导县森林公安分局的业务工作。
（十三）依法组织实施对全县城乡道路交通、机动车辆的管理和驾驶员的培训工作，参与或直接对重大交通事故的查处，维护交通秩序。
分析、研究全县道路交通公安情况，组织处理特大交通事故、涉外交通事帮和交通事故逃逸案件，参与对盗、抢机动车案件的侦破。
依法维护道路交通秩序，组织指挥、疏导交通，纠正和处罚交通违章行为，组织实施交通秩序专项治理和整顿，参与处置治安突发事件，打击各类涉车犯罪，维护公路治安秩序。
指导各机关、团体、企事业单位和学校的道路交通安全工作。依法组织实施对全县机动车辆的安全检测、登记审核、牌证管理。
（十四）承办县委、县政府和上级公安机关办的其他事项。
2、下设单位不同
管理本市监狱管理局和本市劳动教养工作管理局。
业务处室 ：
办公室 ·法制处 ·研究室 ·法制宣传处
律管处 ·公管处 ·基层处 ·司法考试处
计财处 ·法援处 ·审计处 ·行政处
组织处 ·人事警务处 ·宣教处 ·老干部处
纪检委（监察处）
3、内设机构不同
司法局
直属机构 ：
律师协会 公证处 老干部活动中心 市律师培训中心 市法律援助中心等
部门管理机构 ：
市监狱管理局 ·市劳动教养工作管理局
公安局内设机构：
（一）办公室（加挂指挥中心牌子）
（二）国内安全保卫大队
（三）经济犯罪侦查大队
（四）治安管理大队（加挂出入境和外国人管理中队牌子）
（五）刑事侦查大队
（六）禁毒大队
（七）巡逻警察大队
（八）政工办
（九）纪委督察大队（经检室、审计室、警务督察中队）
（十）法制办
扩展资料：
派出单位，从级别上讲都一样，都是科局级单位。
二者相互配合，区别如下：
1、工作内容不同，公安局管公共安全，司法局管民间法律法制工作。
2、司法局是理论者，公安局是实践者。
司法局是政府的司法行政机关。受党委与政府的领导。司法局规格比法院、检察院略低，是政府宣传管理法律的专业职能部门。
公安局是公安机关的组织形式，是主管公安工作的政府下设职能部门。
公安局按级别通常有：直辖市公安局、省会城市公安局、地级市公安局、县级公安局，除县级公安局外，前几者均可按城市的区下分区分局。
特定公安局一般受所在地政府领导、受上级公安厅、局指导。公安机关的最高部门是公安部，指导全国公安工作，包括所有各级公安局。受所在地政府、上级公安机关双重领导
参考资料来源：百度百科-公安局
参考资料来源：百度百科-司法局
2、都是司法部门。
3、公安局主管社会治安，司法局是司法行政部门，主管基层调委会、普法宣传、公证、律师和监狱劳教等。
二者是互相配合的关系。
相关具体职责如下：
司法局是负责本市司法行政工作的市政府组成部门，其主要职责是：
(一)研究起草司法行政方面的地方性法规、规章草案；编制本市司法行政工作的发展规划及年度计划，并监督实施。
(二)负责组织、指导对刑满释放和解除劳动教养人员的安置帮教工作。
(三)负责本市司法行政系统的队伍建设和思想政治工作。
(四)研究制订本市法制宣传教育工作的总体规划，组织、指导、协调全市法制宣传教育工作。
(五)负责管理本市律师、法律援助工作和公证机构及公证活动；研究律师、公证工作的改革与发展，并提出实施办法。
(六)负责管理本市法律服务机构和在京设立的国(境)外律师机构；监督、指导本系统的社会团体工作。
(七)指导本系统法学教育及业务培训工作。
(八)负责指导区、县司法行政部门管理人民调解工作、社区矫正工作及司法助理员、基层司法所和基层法律服务工作。
(九)负责本市司法行政系统的外事工作和对外宣传、交流工作。
(十)指导和管理本市面向社会服务的司法鉴定工作。
(十一)负责本市仲裁机构的登记管理工作。
(十二）负责本市国家司法考试工作。
(十三）负责社区矫正工作
(十四)承办市政府交办的其他事项。
公安局工作职责
（一）按照县委、县政府和上级公安机关的指示，研究部署县公安工作，并指导和督促检查全县各部门贯彻执行情况。
（二）及时准确地掌握全县社会治安情况，分析、研究出现的新情况、新问题，为县委、县政府和上级公安机关提供社会治安方面的重要信息，并提出对策。
（三）负责全县各部门公安机关的业务工作和执法活动。
（四）组织、协调、参与或直接对全县重大案件、重大紧急治安事件、重大治安灾害事故的侦破和处置，以及对特务、间谍等危害国家安全的案件的侦破。
（五）负责全县依法管理社会治安、户籍、居民身份证、外国人管理和出入境工作；加强法制建设；组织、实施、监督消防工作。
（六）领导、参与或直接侦破走私、制造、贩卖、运输毒品的犯罪案件，并组织抓好禁种、禁吸毒品工作。
（七）负责全县看守所、拘留所、戒毒所、收容教育所的管理与执法活动。
（八）负责全县公安机关依法监督机关、团体、企事业单位的安全保卫工作，指导企事业单位保卫组织的建设和业务的开展；指导或直接组织实施对党和国家领导人及重要外宾的安全警卫任务、大型活动的安全保卫工作。
（九）负责全县公安机关的技术侦察、信息通信、公共网络安全监察和科学技术工作，规划公安装备现代化建设。
（十）为全县公安机关提供信息、技术、后勤装备等服务工作。
（十一）负责全县公安政治工作、纪律检查工作、行政监察工作、审计监督工作、警务督察工作，规划、指导和管理全县公安队伍的革命化、正规化建设及公安民警的教育培训工作。
（十二）领导现役鲁甸消防大队工作；领导全县公安消防工作，指导县森林公安分局的业务工作。
（十三）依法组织实施对全县城乡道路交通、机动车辆的管理和驾驶员的培训工作，参与或直接对重大交通事故的查处，维护交通秩序。分析、研究全县道路交通公安情况，组织处理特大交通事故、涉外交通事帮和交通事故逃逸案件，参与对盗、抢机动车案件的侦破。依法维护道路交通秩序，组织指挥、疏导交通，纠正和处罚交通违章行为，组织实施交通秩序专项治理和整顿，参与处置治安突发事件，打击各类涉车犯罪，维护公路治安秩序。指导各机关、团体、企事业单位和学校的道路交通安全工作。依法组织实施对全县机动车辆的安全检测、登记审核、牌证管理。
（十四）承办县委、县政府和上级公安机关办的其他事项。
公安局：公安局承担公安机关的工作职责：预防、制止和侦查违法犯罪活动；防范、打击恐怖活动；维护社会治安秩序，制止危害社会治安秩序的行为；管理交通、消防、危险物品；管理户口、居民身份证、国籍、出入境事务和外国人在中国境内居留、旅行的有关事务；维护国（边）境地区的治安秩序；警卫国家规定的特定人员、守卫重要场所和设施；管理集会、游行和示威活动；监督管理公共信息网络的安全监察工作；指导和监督国家机关、社会团体、企业事业组织和重点建设工程的治安保卫工作，指导治安保卫委员会等群众性治安保卫组织的治安防范工作。
参考资料：百度百科