专著
1.《严嵩传》,独著,35万字,黄山书社,1992年7月
2.《中国经济通史·明代经济卷》,第二副主编并撰稿,90万字,经济日报出版社,2000年8月第1次印刷,2007年再版,国家社科“七五”重点科研课题,国家“九五”重点图书,中国社会科学院优秀科研成果奖
3.《孙奇逢评传》,独著,11.5万字,中州古籍出版社,2003年9月,编入张显清主编《孙奇逢集》中册
4.《明代政治史》,第一主编,98万字,广西师大出版社,2003年12月第1次印刷,2006年11月第2次印刷,国家社科基金项目,中国社会科学院历史研究所优秀科研成果奖
5.《祸国宰相严嵩》,独著,16万字,中国社会科学出版社,2008年4月
6.《明代后期社会转型研究》,主编并撰稿,61万字,中国社会科学出版社,2008年11月,中国社会科学院重大课题(B),纳入中国社会科学院文库
文集
1.《张显清文集》,独著,45.9万字,上海辞书出版社,2005年5月
论文
(除注明者外皆为独著)
(一)社会经济
1.《明代缙绅地主浅论》,2.3万字,《中国史研究》1984年第2期
2.《明代官绅优免与庶民中户的徭役负担》,1.7万字,《历史研究》1986年第2期
3.《明代土地投献简论》,1.4万字,《北京师院学报》1986年第2期
4.《明代缙绅地主减价买田事例》,0.1万字,《中国史研究》1986年第2期
5.《论严嵩的家资》,1.5万字,《北京师院学报》1990年第2期
6.《论明代官绅优免冒滥之弊》,2万字,《中国经济史研究》1992年第4期
7.《近二十年来国内关于明代社会变迁问题研究状况读书札记》,1.1万字,《中国史研究动态》2003年第4期
8.《近三十年来国外关于明代社会变迁问题的研究状况》,0.8万字,《明史研究》第8辑,2003年12月
9.《中国历史“停滞论”的由来和发展》,1.7万字,《明史研究》第8辑,2003年12月
10.《明代后期粮食生产能力的提高》,2万字,《中国社会科学院学术委员会集刊》第1辑,2005年;《学术探索》2005年第5期及中国人民大学书报资料中心《经济史》2006年第1期转载
11.《明代后期农业商品化程度的提高与社会经济结构、农业生产关系的变化》,3.3万字,《纪念许大龄教授诞辰八十五周年学术论文集》,北京大学出版社,2007年12月
12.《晚明社会的时代特点》,0.3万字,《河南师大学报》社科版,2005年第6期。中国人民大学书报资料中心《明清史》2006年第2期转载
13.《晚明:中国早期近代化的开端》,0.8万字,《河北学刊》,2008年第1期;《新华文摘》2008年第8期及中国人民大学书报资料中心《明清史》2008年第5期转载
(二)政治
1.《从〈大明律〉和〈大诰〉看朱元璋的“锄强扶弱”政策》,2.8万字,《明史研究论丛》第2辑,1983年6月
2.《明代亲藩由盛到衰的历史演变》,0.9万字,《社会科学战线》1987年第2期
3.《明嘉靖“大礼议”的起因、性质和后果》,1.4万字,《史学集刊》1988年第4期
4.《〈大明律〉的形成及其反映的时代特点》,1.7万字,《中国史研究》1989年第4期
5.《封建家法是封建国法的补充》,0.9万字,《谱牒学研究》第1辑,1989年12月
6.《“以媚术宠”是严嵩政治品格的典型特征》,0.8万字,《严嵩与明代政治论文集》,上海社会科学院出版社,1989年12月
7.《修仙皇帝》,笔名程德,1.1万字,王春瑜主编《明宫秘闻》,江苏古籍出版社,1992年1月
8.《明末北直清流派的形成及其反阉党斗争》,1.2万字,《明史研究》第3辑,1993年
9.《“洪武重典”说辨析》,日本《明代史研究》第28号,2000年4月
10.《关于明代倭寇性质问题的思考》,2万字,《明清论丛》第2辑,2001年
11.《试论明太祖“以教化为本”的治国思想与实践》,1.2万字,《明史研究》第7辑,2001年
12.《贵州建省:贵州历史的里程碑》,0.2万字,《纪念贵州建省590周年学术讨论会文集》,贵州人民出版社,2004年
13.《廓清对郑和远航动因的曲解》,0.8万字,《纪念郑和下西洋600周年国际学术论坛论文集》,社科文献出版社,2005年
14.《略论郑和远航的动因及其历史意义》,0.7万字,《中国远洋航务公告》2005年第7期
15.《“踪迹建文、耀兵异域”说质疑――纪念郑和远航600周年》,2万字,《中国社会科学院学术咨询委员会集刊》第2辑,2006年2月
16.《明太祖朱元璋社会理想、治国方略及治国实践论纲》,5万字,《中国社会科学院学术咨询委员会集刊》第3辑,2007年
(三)农民起义
1.《王守仁镇压农民起义的反动策略》,2.7万字,《农战史论丛》第1辑,1978年12月
2.《研究明末农战史的一部重要历史文献——〈杨文弱集〉》,0.8万字,《文献》第1辑,1980年1月
3.《张献忠与西方自然科学——读〈圣教入川记〉》,0.8万字,《农战史论丛》第3辑,1981年4月
4.《关于成化年间“妖书妖言”案的史料》,0.4万字,《明史研究论丛》第3辑,1985年5月
5.《张献忠“谷城受抚”评析》,1万字,《明史研究》第1辑,1991年9月
(四)思想文化
1.《论王阳明鼓吹蒙昧主义的反动性》,0.7万字,《山东师院学报》1979年第1期
2.《论海瑞的社会政治思想》(合著),0.8万字,《北方论丛》1980年第4期
3.《徐光启社会经济思想的几个问题》,1.3万字,《晋阳学刊》1981年第4期
4.《晚明心学的没落与实学思潮的兴起》,2.6万字,《明史研究论丛》第2辑,1982年4月
5.《王守仁的唯心史观》,0.8万字,《浙江学刊》1985年第4期
6.《明代社会思想和学风的演变》,1.4万字,《中国哲学史研究》1986年第2期
7.《孙奇逢的“以实补虚”论》,0.8万字,《中州学刊》1986年第6期
8.《孙奇逢的“以实补虚”论》,1.3万字,《明清实学思潮史》第25章,齐鲁书社,1989年7月
9.《张溥及复社“兴复古学,务为有用”的经世思想》,1.2万字,《明清实学思潮史》第29章,齐鲁书社,1989年7月
10.《陈子龙的实学建设》,1.5万字,《明清实学思潮史》第31章,齐鲁书社,1989年7月
11.《试论阳明心学的历史作用》,1.5万字,《孔子研究》1990年第2期
12.《明清实学思潮及其对日本思想文化的影响》,日本《明代史研究》,1991年3月
13.《绚丽的台湾历史风情画卷——读〈台海采风图考〉》,0.3万字,《史学集刊》1992年第2期
14.《朱元璋尊孔抑孟刍议》,0.5万字,《北方论丛》1992年第5期
15.《明清之际杰出教育家孙奇逢述论》,1.1万字,《清史研究》1993年第2期
16.《简论孙奇逢兼容并包的治学方针》,0.6万字,《晋阳学刊》1993年第3期
17.《徐光启引进和仿制西洋火器述论》,1.7万字,澳门《文化杂志》第13、14期,1993年第2季度
18.《科举制历史作用刍议》,0.75万字,《中国社会科学院研究生院学报》1998年第1期
19.《陈子龙:晚明实学思潮的健将——兼论明清实学思潮的一些问题》,1.1万字,《明史研究》第6辑,1999年5月
20.《略论中国传统文化的整体观》,0.4万字,《光明日报》1999年4月2日
21.《要重视明清之际人士文集的整理和研究——以〈孙奇逢文集〉为例》,1.3万字,《明人文集与明代研究》,台湾乐学书局,2001年
22.《传统与启蒙》,0.9万字,《明代文化研究》,中国文史出版社,2003年9月
23.《大运河:中国早期启蒙思想的摇篮》,0.3万字,《运河之都——淮安全国学术研讨会论文集》,中国书籍出版社,2007年
24.《试析明定陵考古发掘的学术和社会意义》,0.8万字,《世界文化遗产——明清皇家陵寝保护与发展研讨会论文集》,北京燕山出版社,2007年7月
(五)序文、评论
1.《名相传》序,海南出版社,1994年
2.王俞春编著《海南进士传略》序,花城出版社,1998年
3.卞利著《胡宗宪评传》序,中国文联出版社,2001年
4.宠中威著《定陵发掘亲历记》序,学苑出版社,2002年
5.《孙奇逢集》总序,中州古籍出版社,2003年
6.梁颂成辑校《杨嗣昌集》序,岳麓书社,2005年;《湖南文理学院学报》(社科版)2006年第2期转载
7.赵克生著《明朝嘉靖时期国家祭祀改制》序,社会科学文献出版社,2006年
8.郭培贵著《明史选举志考论》序,中华书局,2006年
9.明孝陵博物馆编《明孝陵碑刻》序,广陵书社,2006年
10.明孝陵博物馆编《明帝王陵碑刻精品》序,广陵书社,2009年
11.胡凡著《明代历史探赜》序,中国大百科全书出版社,2009年
12.读汤纲、南炳文著《明史》,《光明日报》1992年6月28日
13.评《朱元璋研究》(陈梧桐著),《中国史研究动态》1994年第6期
14.《家长制专制封建社会论——记近年来王毓铨先生对明代及中国封建社会形态基本特征的论述》,0.5万字,《明史研究》第4辑,1994年
15.《他们赢得了赞誉》,《中国社会科学院院报》2000年12月12日
16.《重要的在于科学地说明历史——评沈定平著〈明清之际中西文化交流史〉》,《中华读书报》2002年1月16日
17.《增强使命感 深化历史学研究》,《光明日报》2002年5月28日
18.《发挥优势 承担重任》,《中国社会科学院院报》2002年7月30日
(六)纪念吴晗
1.《〈吴晗史学论著选集(第一卷)〉读后》,0.5万字,《晋阳学刊》1985年第3期
2.《吴晗与明定陵的发掘》,0.2万字,《中国社会科学院院报》2002年1月15日;《科学中国人》2002年第9期转载
3.《难忘的四年——缅怀吴晗先生》,0.55万字,《求真务实五十载——历史研究所同仁述往》,中国社会科学出版社,2004年
4.吴晗著《明史简述》导言,0.25万字,中华书局,2005年
5.《谈谈吴晗的历史贡献》,0.3万字,《中国社会科学报》2009年10月29日
6.《从创造到普及:吴晗先生的学术贡献》(与赵克生合著),1.5万字,《古代文明》2009年第3期;《新华文摘》2009年第19期转载
古籍整理、辞书:
1.《谷山笔麈》(于慎行著),合作点校,10万字,《明史资料丛刊》第3辑,1983.6
2.《清代台湾农民起义史料选编》,23.6万字,合编,主持人,福建出版社,1983年
3.《曲阜孔府档案史料选编》,大型集体项目,齐鲁书社
4.《中国事典》明代卷主编之一,明代卷100万字,沈阳出版社,1992年7月
5.《中国历代治国策选粹》明代卷编委之一,明代卷30万字,高等教育出版社,1994年
6.《文白对照二十五史精华》,编委会委员,海南出版社、三环出版社,1993年
7.《名相传》(《文白对照二十五史分类传记》),主编,52.3万字,海南出版社,1994年
8.《余冬序录》(何孟春著),6万字,《中华野史·明代卷》,泰山出版社,1999年
9.《孙奇逢集》,主编,304万字,中州古籍出版社,2003年
10.《中国大百科全书》、《不列颠百科全书》等辞书某些辞条的编写