2000年6月撤榆林市设榆阳区，榆林地区改设为榆林市，榆阳区隶属榆林市。2001年12月撤乡并镇，全区辖12个镇、12个乡、4个街道。2003年3月新设崇文路、航宇路、驼峰路3个街道办事处。2011年7月在次撤乡并镇，撤销安崖镇、刘千河乡、余兴庄乡、合并改置为大河塔、青云、古塔3个镇。
2013年末，榆阳区辖榆阳、鱼河、上盐湾、镇川、清泉、鱼河峁、大河塔、麻黄梁、牛家梁、金鸡难、马合、巴拉素，古塔，青云14个镇，孟家湾、小壕兔、岔河则、小纪汗、补浪河、红石桥、芹河7个乡，488个村民委员会，1880个村民小组。1个居委会，4个村民小组。设鼓楼、新明楼、上郡路、青山路、崇文路、航宇路、驼峰路7个街道办事处49个社区居民委员会，307个居民小组。 榆林市榆阳区下辖街道办事处 街道办 机关驻址 直辖 新明楼街道贾盘石中巷16号辖八狮巷、定惠寺、新明楼、万佛楼、三官会、灵秀街6个社区居民委员会，下设42个居民小组。 鼓楼街道红山西路2号辖红文昌、普惠泉、鸳鸯湖、城隍庙滩、凯歌楼、二里半6个社区居委会，下设33个居民小组。机关驻址。 青山路街道西沙常乐路辖建安路、柳营路、保宁路、文化路、常乐路、福安6个社区，下设42个居民小组。 上郡路街道上郡北路100号辖凌霄塔、秦怀路、夏州路、德静路、永康路、开光路、肤施路7个社区居民委员会，下设40个居民小组。 航宇路街道航宇路中段辖航宇路、乡企城、龙洋、松林路、榆康路、明珠路6个社区居委会，下设30个居民小组。 崇文路街道西人民路中段辖崇文路、迎滨路、芹涧路、春苑、聚财、学院、榆龙7个社区居委会，下设50个居民小组。 驼峰路街道驼峰北路辖金华路、兴中路、长虹路、东岳路、望湖路、桃源路、金阳、金苑8个社区居委会，下设64个居民小组。 榆林市榆阳区下辖乡镇 乡镇 机关驻地 直辖 榆阳镇长城南路辖吴家梁、红山、北岳庙、官井滩、广榆、王家楼、广济北、广济南、新乐、永乐西、榆阳东、永乐东、榆阳西、五雷沟、金刚寺、流水沟、杏墕、南川、沙河、沙河口、三岔湾、刘官寨、向阳山、大河滩、西沟、韦家楼、归德堡、花园沟、徐庄则，共29个村委会，下设99个村民小组。 鱼河镇鱼河堡辖郑家沟、王新庄、南沙、清兴庄、鱼河、新立、新建、王沙坬、许家崖、高家坬、新庄科、李家沟、王庄、梁渠、寺伙沟、米家园则、房家沟17个村委会，下设39个村民小组。 鱼河峁镇鱼河峁村堡辖沙墕、谢家峁、傅家畔、刘寨、常楼、胡家沟、冯茶庄、田兴庄、兆黍沟、董家湾、拐上、崔墕、郭家湾、黄崖窑、刘崖窑、柏盖梁、白家沟、冯庄、唐家沟、刘贺山、沙沟梁、东岔、西岔、鱼河峁、刘小沟、田园、高成沟、张家佥、梅家畔、南傅家畔、小范地、大碾庄、朱庄、杨庄、桐条沟、杏树峁、小常峁、桃家沟、王家沟、高家峁、李府沟41个村委会，下设112个村民小组。 上盐湾镇上盐湾村辖上盐湾、碎金驿、姬家坡、崖窑沟、好皮梁、孙山、林家沟、林家山、武家沟、强家渠、柏树沟、郭家沟、杨柳川、周家墕、鱼家沟、高家湾、二官山、苏家墕、高家墕、伙梁城、桑林坬、郭兴庄、党山、陈兴庄、陈崖窑、赵家畔、党街则、铁炉峁、郭山、马山、石马沟、寨坬32个村委会，下设89个村民小组。 镇川镇瓦岗寨辖八塌湾、红柳滩、陈家坡、柳湾、高梁、朱寨、河上、杨庄、花渠、瓦岗寨、寺沟、刘家湾、南坬、庙湾、东街、西街、赵山、秦山、芦草沟、方渠、侯渠、葛村、高沙沟、刘兴庄、樊河畔、街上、张佥、田寨坬、周圪坨、周沟、石崖底、杨正沟32个村委会，102个村民小组，1个居民办事处。 清泉镇刘山村辖寇寨则、书房湾、尹家庄、新庄则、大场滩、秦圪塔、赵渠、崔坪、设家沟、青草梁、曹家湾、持家峁、大麦条、石窑坪、马家梁、向阳山、向阳沟、小庄、吴庄、刘山、石窑、赵家沟、王寨、崖窑焉、双念、王界、钟家焉、党家焉、炭峁沟、芦家沟、旋水湾、崖窑畔、井道峁、寨峁山、念则湾35个村民委员会、下设126个村民小组。 古塔镇刘姚庄村辖姚庄、清水沟、张雷沟、悟明寺、韩家梁、郭石畔、石井、王昌沟、松树峁、黄家圪劳、赵庄、堡山、石山、王家峁、罗佥、杭庄、张大沟、任家沟、许家山、庞寨则；马家峁、马响水、黄峁沟、宋家沟、张家畔、赵家峁、阎家沟、崔家河、王岗畔、陈家沟、双伏则、酸刺墕、阎庄沟、常家墕、铁沟坬、曹家坬、马家沟、余兴庄、石庄、王渠、朱家峁、王前畔、洪水沟、木瓜峁，共44个村委会，下设94个村民小组。 青云镇青云村辖尤家湾、崔家畔、刘家坬、跳沟则、南峁庄、钟家沟、青云、郑家川、李家山、太平沟、稻科湾、柳树沟、宣沟、色草湾、杜家沟；刘千河、峰山、鸦罗畔、褡裢沟、蔺家畔、高家沟、杨渠、乐家畔、新寨、郭沙畔、白城峁、果园塌、殷家墕、王家坬、朱岔、康家湾、刘家畔、刘家沟、聚福梁、李家崾、南大圪达、慕渠、胡岗、朱家墕，共39个村民委员会，下设139个村民小组。 大河塔镇冯家湾村辖西尧则、香水、方家畔、后畔、兰家峁、大河塔、石灰窑、柴兴梁、断桥沟、牛圈沟、刘赵沟、青草沟、王家崖、马家梁、杨家畔、任庄则；高沙峁、韩家坡、黄家沟、页梁湾、王岔、安崖底、刘岔、鱼河湾、胡家圪劳、房崖、枣树焉、烟洞山、杨会塔、卢家铺、石瓦寺、红花渠、房老庄、黑柏沟、驮柴峁、庞窑则、沙舍科、前杜家沟、后杜家沟、王达畔、暖水沟、白南沟、王南沟、焦崖窑、稍沟、田家寨、白兴庄47个村民委员会，下设146个村民小组。 麻黄梁镇大圪挞村辖磨庄、花龙镇、旧堡、乔界、盘云界、十八墩、北大圪达、王家湾、东清水河、断桥、李家峁、刘占峁、王庄、黑龙滩、崖窑沟、瓦窑沟、张虎沟、十字墕、段家湾、店坊、阎山、双山、东刘家畔、大沟24个村委会，下设119个村民小组。 金鸡滩镇周纪伙场辖金鸡滩、曹家滩、喇嘛滩、白舍牛滩、柳卜滩、柳树滩、掌盖界、上河、海流滩、小坟滩、金海南、金海北12个村委会，下设94个村民小组。 牛家梁镇牛家梁村辖赵元湾、转龙湾、高家伙场、郭家伙场、王则湾、什拉滩、牛家梁、谢家坬、城大圪堵、大伙场、边墙、常乐堡12个行政村，72个村民小组。 马合镇马合村辖补浪、乌杜当、东马合、西马合、补兔、郝家伙场、杨家滩、达拉什、麻生圐圙、脑冒海则10个村民委员会，下设58个村民小组。 巴拉素镇白家伙场辖巴拉素、马家兔、元大滩、讨讨滩、三场滩、白城台、大旭吕、小旭吕、大顺店、忽惊兔、讨忽兔、新庙滩12个行政村，下设52个村民小组。 孟家湾乡孟家湾村辖孟家湾、四道河则、圪求河、王家圪堵、大海则湾、三道河则、神树湾、马场、马大滩、恍忽兔、三滩、板城滩、野目盖、树肯壕、波直汗15个村民委员会，下设72个村民小组。 小壕兔乡小壕兔村辖旋河、刀兔、早留太、沙则汗、公合补兔、东奔滩、乌素采当、小壕兔、大壕兔、贾明采当、史不扣、掌高兔、西奔滩、忽缠户、特拉采当、贾拉滩、包兔、巴汗采当、海代、耳林20个村民委员会，下设94个村民小组。 小纪汗乡小纪汗村辖昌汗界、黄土梁、小纪汗、长草滩、奔滩、波罗滩、井克梁、大纪汗，牙世兔、可可盖、昌汗峁、大海则、阿拉补、敖包14个村民委员会，下设76个村民小组。 岔河则乡岔河则村辖石峁、岔河则、排则湾、白河庙、河口、灯笼滩、什它汗7个村民委员会，下设50个村民小组。机关驻地。 补浪河乡补浪河村辖补浪河、云家滩、蒿老兔、那泥滩、巴石壕、点石、纳林、小滩、耳林、点连素、省不扣、曹家峁、吴房、魏家峁、昌汗敖包15个村民委员会，下设95个村民小组。 红石桥乡红石桥村辖马路湾、双红、红石桥、王连圪堵、韩家峁、柳卜台、武松界、闹牛海则、房梁、井界、油房湾、张家湾、古城界、左界、肖峁15个村民委员会，下设65个村民小组。 芹河乡马家峁村辖谷地峁、水掌、马家峁、思家海则、长海则、纪小滩、长城则、啊达汗、红墩、郑滩、张滩、蟒坑、前湾滩、黄沙七墩、酸梨海则、天鹅海则等16个村民委员会，78个村民小组。
