6号线一期的西段最初与东段一样也在朝阜大街地下，由于中间穿过了北京皇城且接近故宫，而受到较大的文物保护压力。为了避免文物保护的问题，整个西段向北平移了1.5公里，到了平安大街地下，形成今天的6号线的路线。
2007年10月，6号线规划方案获批复 ；12月8日上午，6号线正式开工 。
6号线一期最初设计褡裢坡站、黄渠站、常营站为3个高架站点。 由于东五环附近的朝阳北路未来将形成类似天通苑的密集居住区，为降低噪音对居民的干扰，最后在2008年10月做出站台全部入地的决定。
2009年1月17日，十里堡站开始占路施工，为6号线一期第一个动工的车站 ；6月7日，6号线被确定为运行8节编组列车的线路 。2009年国庆节前，平安里站至北海北站区间暗挖隧道施工完成 。
2010年1月14日，6号线一期的规划方案及站点位置图在北京市规划委网站进行公告 ；3月22日，6号线一期开始进行盾构施工 ；5月4日，6号线一期沿线车站站名命名预案进行公示 ；11月11日，6号线一期沿线车站正式命名，其中“甜水园站”更名为“金台路站” ；12月15日17时许，东四站施工工地内一泥浆池发生爆裂，致使马路结冰 ；12月，朝阳门站下层导洞施工完成 。
2011年2月25日，青年路站在全线率先封顶 ；2月28日，6号线二期开工 ；4月2日，中国铁道科学研究院公布《北京地铁6号线西延线工程环境影响评价第一次公示》，公示显示S1线东段被6号线西延长线（东起五路居，西至苹果园，全长8.93千米，设5座车站）代替 ；5月18日9点左右，十里堡站工地隧道发生局部坍塌，一名工人被埋 ；6月1日2时30分许，平安里站工区发生塌方事故，一名工人被埋，后经抢救无效身亡 ；8月，一期终点站草房站实现结构封顶 。
2012年2月8日，为解决6号线和16号线换乘问题，北京市规划委确定在白石桥南站和车公庄西站之间增设“二里沟站” ；2月15日，6号线首列样车抵达北京 ；4月15日，6号线一期实现洞通 ；5月，6号线一期开始进行车站装修 ；6月30日，6号线一期实现轨道贯通 ；9月20日，6号线一期开始空载试运行 ；11月29日，6号线一期五里桥车辆段通过竣工验收 ；12月30日，6号线一期（总长30.4千米，共设20座车站 ）开通（二里沟站暂缓开通） 。
2013年4月28日上午，6号线二期16标段盾构始发仪式在东夏园站举行，“铁盾一号”盾构机成功始发 ；同年12月，6号线西延工程开工 。
2014年2月12日，6号线西延调整规划，将苹果园南路站和苹果园枢纽站（1号线和S1线换乘）由高架车站调整为地下站，并向西延伸一站至金安桥东南角，设金安桥站与S1线及规划11号线换乘，线路全长从原来的8.9千米延长至10.3千米 ；2月，6号线二期实现洞通 ；4月，6号线西延石景山段进场施工 ，同时6号线二期开始铺轨 ；5月3日，北运河东站封顶 ；5月22日，6号线二期潞城站已经做出东延的条件，潞城站距离河北燕郊约几千米 ；8月1日，6号线开行草房站至车公庄西站区间车 ；8月20日，6号线二期与一期贯通调试 ；9月1日，6号线二期开始动车调试 ；9月20日，6号线二期开始空载试运行 ；10月31日，北京市规划委网站公示6号线二期沿线车站站名方案 ；12月14日，北京市轨道交通管理有限公司第四项目管理中心对6号线二期通运门站进行单位验收 ；12月28日，6号线二期（总长12.4千米，共设8座车站 ）开通（通运门站和北运河东站暂缓开通） 。
2015年6月，6号线西延工程完成土建工程10%，区间90%进场，车站60%进场。受施工难度影响，开通时间暂时无法确定。 同年10月15日，6号线新编平日列车运行图于正式实施，根据新编运行图显示，早高峰运行间隔由3分15秒缩至3分，运力提高8.3%。 6号线西延（三期）工期计划项目 征地拆迁 车站主体结构 设备安装 洞通 轨通 首车到场 系统联调 试运行 竣工验收 正式运营 6号线三期 2013.12 2015.1 2015.5 2016.1 2016.5 2016.8 2016.9 2016.9 2016.11 2016.12.28
北京地铁6号线2012年建成通车 当时有海淀五路居-草房 一期工程长的就已经不可思议了 如今的6号线金安桥-潞城 半程为金安桥-草房 全程跟一期终点站都不沾边 一头连接着北京磁悬浮一号线 右边出境啦！到了大厂回族自治县潞城镇 牛x呀！
6号线从西近郊到大厂县 也是下了不少功夫 最早规划最终为苹果园-燕郊东小营 但是由于燕郊政府不出钱 所以就只能修到大厂了 这么长的地铁线路 确实是继1号线之后的一条切切实实的主干线 为啥这样说呢？ 因为普通的列车是6节车厢 它是八节？
不仅仅是这个 六号线的轨道是没有电的 为其他方式供电 这样好救援
六号线当满载率达到百分之二十时 极为舒适 跟家一样温暖 为啥呢 夏天 众所周知有空调 不跟出租车的一样想吐的感觉 冬天座位下面有加热器 很暖和 感觉地铁开了暖气 六号线采用新车 不是闷罐车！！ 所以时速肯定在八十以上的啦。由于经过著名景点 所以也挺有风味啦 大厂回族自治县人到这里都容易啦嘻嘻😁 北海北连接北海公园 南锣鼓巷众所周知 北海北有绿柱子和壁画 那南锣鼓巷呢？
当当当当
额......挺好的金安桥-海淀五路居出站过道会有古色古香的壁画 海淀五路居在候车的左边 八节车厢 不耽误坐车
里面很现代化（车厢）LED屏幕很人性化 依靠座位不用平视啦，一看这就不是六号线车厢 下面没加热器 这还不是重点 苹果园以后好歹也换乘一号线 这车换乘的线路都挺好 5、8、9、2等线路 这真是一个主干线啊！