临床专业高校排名第一的是北京协和医学院，其次是北京大学、复旦大学等。
1、北京协和医学院
北京协和医学院开创了我国八年制医学教育、高等护理教育、住院医师培训制度和现代公共卫生教育，取得了“北京猿人研究”“单体麻黄素提取”“黑热病研究”等一系列重要成果。
中国医学科学院在脊髓灰质炎疫苗研发、全国控制和基本消灭麻风病、根治绒毛膜上皮癌化学疗法的创建与推广、我国抗生素自主研发和工业化生产等方面做出了创造性贡献。
目前，院校已发展成为拥有19个研究所、6家附属医院、9个学院、106个院外研发机构，集医教研产为一体的国家级综合性医学科学研究机构。
2、北京大学
北京大学医学部地处北京市海淀区，前身是创建于1912年的国立北京医学专门学校，是中国政府依靠自己的力量开办的第一所专门传授西方医学的国立医学校。1996年，通过国家首批“211工程”建设项目论证。
2000年，与北京大学合并，同年启动“985”计划，随着与校本部的深度融合发展，医学取得长足进步。近年来，在“双一流”建设支持下，进入了新的发展阶段。
北大医学集教学、科研、医疗为一体，学科覆盖医学门类中的基础医学、临床医学、口腔医学、药学、公共卫生和预防医学、护理学、医学技术、中西医结合以及理学、工学、教育学、哲学、文学等门类的部分学科。
3、复旦大学
复旦大学上海医学院（简称“复旦上医”）地处上海市徐汇区，创建于1927年，创立时名为国立第四中山大学医学院，是中国人创办的第一所国立大学医学院，颜福庆出任首任院长。1932年，独立为国立上海医学院。
院训是“正谊明道”，出自《汉书董仲舒传》：正其谊不谋其利，明其道不计其功。1939年，内迁至云南昆明。1940年，辗转迁至四川重庆。1946年，抗战胜利，迁回上海。1952年，更名为上海第一医学院。1959年，被定为全国16所重点高等学府之一。