法律分析：农村合作医疗卡丢了需要去县卫生局新农合办公室补办，参保人持有户口本或身份证，即可申请办理农村合作医疗卡。通常是当天办理，当天就可以领到新卡，但如果有特殊情况，区农村合作医疗办也会给大家在规定的时间内进行新卡补办。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》
第二条 国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度,保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。
第二十六条 职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。
第二十八条 符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。