新三板公司破产跟其他企业破产处理机制是一样的，根据目前情况，中国实行的是绝对的破产申请主义,即破产程序只能由法定破产申请权人提出申请而开始,法院不得依职权主动开始破产程序(见最高人民法院《关于贯彻执行〈中华人民共和国企业破产法(试行)〉若干问题的意见》第15条,以下简称《破产意见》)。根据《破产法》及《民事诉讼法》的规定,债权人和债务人均可依法提出破产申请。
新三板企业破产的话，那么清算的资产一般要先支付清算费用、国家税收、员工工资等，然后才考虑股东的利益。一般破产的公司，早就资不抵债了，也少有资产给股东分了。
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