《甄嬛传》剧版的甄嬛是这部剧的大赢家，她用自己的手段和心机，把所有跟她作对的人拉下了马，甚至是皇上也没有能幸免。但是原著中的甄嬛却没有这么幸运，她所经历的事情就非常坎坷了。
在原著之中，甄嬛和果郡王允礼之间的事情，网上早有耳闻，但是碍于颜面黄皇上那个不能做出任何的表示。但是后来蒙古的摩格来到了朝廷，甚至向皇上提亲，请求皇上把甄嬛嫁给自己。这无异于在打皇上的脸，再想到甄嬛和允礼之间的事情，皇上想出了一个非常狠毒的计策。
皇上叫玄凌，果郡王叫玄清
在剧中助甄嬛回宫是一对龙凤胎是果郡王的，在原著里面也是一样的，只是后来准葛尔可汗要求娶甄嬛，电视剧里面的皇上没有答应，没有让甄嬛去，但是原著里面皇上让甄嬛只身犯险，王爷带着人去救甄嬛，甄嬛的三妹把甄嬛换了过来，可汗也同意了，那时候两个人在一起了，后来甄嬛偷偷回宫，皇上自然认为孩子是他的，原著里面皇上的女儿称作帝姬，这个女儿起名为雪魄帝姬。
其实，甄嬛生下的双生子到底是谁的，这是一个很大的疑问，因为甄嬛和皇帝果郡王二人在一起的时间，太过接近了。甄嬛对皇上侍寝的时间与果郡王圆房的时间差距不过一两月。而且甄嬛怀上的还是双生子，这让她肚子里的孩子父亲究竟是谁的就很可疑。
虽然甄嬛承认过孩子是果郡王的，她也是在为皇上侍寝之前怀上的孩子，可是也不是没有可能孩子一个是果郡王的，一个是皇上的。这虽然离谱，却也是有科学依据的，曾经就有一个女子，双胞胎之中有一个是丈夫的，另一个则是与情人的孩子，虽然这样的案例存在的可能只有千万分之一，但也不是不可能发生。甄嬛很有可能先是怀上了一个果郡王的孩子，然后对皇上侍寝的时候又受孕了一次，再次怀上了另外一个孩子，那样就会存在有一个孩子是果郡王的，一个孩子是皇上的。
虽然这个结果却是令人难以接受，但是还有一个小细节可以看出端疑，之前温实初发现甄嬛怀孕时，并没有说出甄嬛怀上的是双生子，而是在甄嬛入宫之后诊断出甄嬛腹中有两个孩子，这样不严实的口述实在不适合在这里，实在是有些三缄其口。
毕竟温实初的医术高明，要诊断出甄嬛腹中到底有几个孩子还是可以的，可是为何之前没有把这个“好消息”说出，直到甄嬛回宫才得出结论呢？这实在令人匪夷所思，唯一能够解释的便是，甄嬛刚诊断有孕时只有一个孩子，与皇上缠绵之后又怀上孩子，所以温实初才会诊断出双生子。
皇上同意将甄嬛嫁给摩格，表面上皇上的允许了，但是背地里面皇上却让甄嬛带上毒药，让她和摩格同归于尽。这样一来，皇上既可以报这等羞辱之仇，又可以神不知鬼不觉的解决掉甄嬛，让那些扫他颜面的事情归于尘土。
就在甄嬛穿上嫁衣踏上和亲的路之后，果郡王允礼带着甄嬛的妹妹甄玉姚，不远千里地追上了和亲的队伍。果郡王提出用年轻貌美的甄玉姚交换甄嬛，一开始摩格不怎么愿意，但是看着年轻漂亮的甄玉姚，摩格慢慢的开始动摇了。
这个甄玉姚不得不说真的是个人物，她看出了摩格的动摇，于是便向摩格分析自己对时势的见解，如果真的把甄嬛娶回去的话，肯定会造成朝廷对他产生恨意，真就是在作死在跟朝廷结仇。再或者他带走甄嬛只是因为甄嬛膝下有两个皇子，一个是四皇子一个是弘瞻，而且这两个孩子继承皇位的可能性是非常大的，他是想用甄嬛来牵制他们二人。但是甄玉姚则表示如果他这样做的话，就会遭到朝廷的报复。
在经过深思熟虑之后，摩格带走了甄玉姚，而允礼带走了甄嬛。甄嬛和允礼在回去的路上，他们之间再一次有了肌肤之亲，而这一次甄嬛也是成功怀上了允礼的孩子。之后允礼本想带着甄嬛远走高飞，但是甄嬛却执意要回去报仇，最后在皇宫之中生下了允礼的孩子。