南京市妇幼保健院拥有强大的医疗资源，医院内开放床位多达380张，为市民提供充足的服务空间。该机构的职工总数为806人，其中专业卫生技术人员达到616人，高级职称的专业人才有85位，体现了医院在人才队伍上的高水准。
医院设有详细的科室划分，包括12个一级科室、44个二级科室和11个医技科室，这些科室涵盖了产前诊断研究室、省级重点专科产科，以及妇科、儿童保健科这两个市级重点专科。中医科更是被列为南京市中医重点建设单位，展示了在传统医学领域的特色与实力。
院内设有市妇女保健所、儿童保健所和新生儿疾病筛查中心，为妇女和儿童的健康提供全方位保障。此外，医院还在2004年建立了多个专业中心，如江苏省优生学质控中心、产前诊断超声影像中心等，以及与国际接轨的合作项目，如中澳生殖研究中心、加中儿童健康基金会-南京妇幼口腔保健诊治中心等，显示了其在医疗技术和服务上的国际化视野。
在医疗设备方面，医院配备了先进的医疗仪器，如实时三维彩超、放射影像成像系统、全自动生化仪等，价值超过万元的设备多达374台，展现了其现代化的医疗设施。2006年，医院的门急诊人次达到623,980，收治病人13,244人次，成功迎接了7,652个新生命的到来，这些数据反映了医院在医疗服务上的高效和专业。
南京市妇幼保健院（南京医科大学附属南京妇幼保健院、国家级爱婴医院、江苏省首家三级甲等妇幼保健院）创建于1936年，前身为国立中央高级助产职业学校附属产院。历经71年风雨，在几代人的奋发努力下，该院规模不断扩大，业务迅速发展，已成为集妇女儿童保健、医疗、教学、科研为一体的、在社会上享有盛誉的市级妇幼保健院。