郑军健的职业历程如下：
1972年8月至1979年8月：在南宁市工人文化宫担任放映员。
1979年8月至1983年7月：在南宁师范学院中文系攻读中文专业，获得文学学士学位，并任教员和团总支书记。
1983年7月至1984年9月：任南宁师范学院团委副书记和德育教研室助教。
1984年9月至1993年1月：在广西师范学院任职，从助教晋升至副教授，担任艺术教研室主任，并进修中国古代文学硕士研究生课程（1990-1991年）。
1993年1月至1993年6月：在广西自治区高校工委担任宣传部干部。
1993年6月至1996年1月：先后升任组织部副部长和宣传部部长，兼任自治区教委思政处处长。
1996年10月至1998年9月：继续在组织部工作，同时在中央民族大学攻读民族经济硕士研究生课程。
1998年9月至1999年9月：试用期一年后，任自治区教育厅副厅长和自治区社科联副主席。
1999年9月至2000年2月：继续担任教育厅副厅长和社科联副主席。
2000年2月至2000年5月：成为南宁市副市长，市政府党组成员。
2000年5月至2003年5月：在副市长职位上，负责南宁职业技术学院党委书记（兼）工作。
2003年12月至2007年4月：除了副市长，还担任南宁职业技术学院党委书记、广西国际博览事务局副局长和党组成员。
2007年4月至2008年4月：继续在博览会和商务厅担任多个职务，包括国际博览事务局局长、党组书记，商务厅副厅长等。
2008年6月至今：担任中国-东盟博览会秘书处秘书长，广西国际博览事务局局长、党组书记，商务厅副厅长和党组成员。
郑军健曾是南宁市第九、十次党代会代表，南宁市委第九、十届委员，以及南宁市第十一、十二届人大代表。