法律分析：自然人独资有限责任公司不一定是小规模纳税人。小规模纳税人是指年销售额在规定标准以下，并且会计核算不健全，不能按规定报送有关税务资料的增值税纳税人。（所称会计核算不健全是指不能正确核算增值税的销项税额、进项税额和应纳税额）。纳税人一般指课税主体。课税主体是课税客体的对称。亦称“纳税人”或“纳税义务人”。
法律依据：《中华人民共和国增值税暂行条例实施细则》第二十八条 小规模纳税人的标准为：（一）从事货物生产或者提供应税劳务的纳税人，以及以从事货物生产或者提供应税劳务为主，并兼营货物批发或者零售的纳税人，年应征增值税销售额在50万元以下的；（二）除规定以外的纳税人，年应税销售额在80万元以下的。