高效液相色谱原理大多是分配色谱，就是说样品被固定相（柱子填料）吸附以后，在流动相洗脱过程中，样品的极性不同，在流动相中溶解的浓度也不同，有的可以互溶，有的不容，有的有一定
溶解度。就可以根据这个原理进行分离。
流动相的选择与注意事项1.流动相性质（1）液相色谱的流动相根据作用可分为底剂和洗脱剂。底剂决定基本的色谱分离情况，洗脱剂对某几个组分选择分离。流动相组成改变，极性改变，可显著改变组分分离状况；（2）亲水性固定液常采用
疏水性流动相，即流动相的极性小于固定相的极性，称为正相液液色谱法，极性柱也称正相柱。正相柱的底剂用低
极性溶剂，洗脱剂则选用极性较强的针对性溶剂。（3）若流动相的极性大于固定液的极性，则称为反相液液色谱，非极性柱也称为反相柱。组分在两种类型分离柱上的出峰顺序相反。反相柱通常以水为流动相的主体，再加入不同配比的有机溶剂做调节剂。