大革命运动席卷江西期间，永新籍共产党员欧阳洛、刘真等回到家乡，在永新县城秀水小学秘密创办平民夜校。在县城做手艺的朱昌偕，满怀喜悦心情，第一个报名参加学习。接受夜校的革命启蒙教育后，朱昌偕思想觉悟提高很快，1926年夏天，加入共产主义青年团。10月，永新县成立工会，朱昌偕被选为永新青年工人联合委员会委员长。在省工会的领导下，永新青工委办刊物，组织宣传队、演剧队、歌咏队，在群众中广泛宣传革命真理，带领青工们查烟禁赌，破除迷信，维护社会治安，深受群众拥护。
1927年初，朱昌偕加入中国共产党。5月，中共永新县临时县委成立，朱昌偕担任县委委员，负责工会工作。大革命失败后，他随县委撤退到永、宁边境的九陇山、小西江区一带继续坚持斗争。
1927年11月，朱昌偕在宁冈茅坪象山庵参加了宁冈、永新、莲花三县负责人会议。会议主持人毛泽东对建立根据地、开展武装斗争、进行土地革命的问题作了精辟论述，使朱昌偕受到了深刻的启迪。为了迅速恢复和发展永新党组织，他深入各乡各村宣讲革命，发动斗争。不久东南特区委和特区赤卫队相继成立。1928年5月，朱昌偕任永新县工农兵政府主席。他组织和领导工人努力生产，支援红军，并掀起了轰轰烈烈的扩红运动，许多青年工人纷纷加入红军队伍。7月，红军大队转战湘南，赣军11个团乘机进攻永新，实行“会剿”，在毛泽东和边界特委统一布置下，朱昌偕率领200余工人赤卫队员配合红军，埋伏在南乡州湖一带，牵制、困扰、袭击敌军达25日之久，为反“会剿”的胜利做出了贡献。9月，朱昌偕被任命为永新县委书记。10月，中共湘赣边界特委第二次代表大会召开，朱昌偕当选为第二届特委委员。12月，湘赣边界特委改组，朱昌偕担任了特委常委，兼任永新县委书记。他工作积极主动，能力强，当时边界特委书记杨克敏在写给党中央的报告中说到：永新县委书记朱昌偕工作能力强，且相当积极。
1929年1月，井冈山军事根据地被敌人占领。2月初，敌军又向九陇山军事根据地发起进攻。由于当时湘赣边界特委机关在突围中被打散，各县处于群龙无首状态。形势危急之下，朱昌偕以特委常委身份，挺身而出，召集刘作述、鄢辉、谭家述等共同商议保卫九陇山根据地事宜，将三县赤卫队编为赤卫总队，分兵扼守三个山口，抵抗敌军进攻。经过三天三夜的苦战，赤卫总队弹药耗尽。为了保存实力，朱昌偕当机立断，命令部队分头转移，进入深山老林。2月，中共湘赣边界临时特委成立，朱昌偕当选为临时特委书记，领导边界各县进行对敌斗争。
1929年5月后，朱昌偕重新担任中共永新县委书记的职务。他和县委其他同志一起制定了切实可行的工作计划，跋山涉水，深入区、乡检查指导工作，帮助解决困难，使永新县各项工作很快取得成效。8月底，永新党员人数已发展到4000余人，大部分区、乡建立了秘密和公开的苏维埃政权。
1929年8月，朱昌偕正式担任湘赣边界特委书记。当时，永新县城尚被敌人占领。为了攻打永新，朱昌偕和县委同志制定了详细的战斗方案，组织了赤卫队并进行培训。10月30日，朱昌偕、刘作述、徐彦刚、贺曙光等率领永新地方武装一举攻克永新县城。12月，在永新县城召开永新县第一次工农兵代表大会，出席会议代表200余人，会上重新建立了永新县苏维埃政府，朱昌偕当选为政府主席。在县工农兵代表大会结束后，全县各区、乡贯彻代表大会的精神，普遍重新成立了区、乡苏维埃政权。
